Chromosome 11

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology

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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 NA

ENTITIES: by Chromosome band

X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 11


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Band 11q11

chr11:53400000-55800000 (2400 Kb)

  • Chromosomal abnormalities in band 11q11
  • Genes in band 11q11 (reference hg38)
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    Chromosomal abnormalities in band 11q11

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    Band 1Band 2ClassEntityPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphology[PubMed][Study]
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      Mitelmandel(11)(q11q23)  Mitelman (CGAP) Chronic lymphocytic leukemia  
      Mitelmander(11)t(11;12)(q11;q11)  Mitelman (CGAP)LungSquamous cell carcinoma  
      Mitelmander(2)t(2;11)(p24;q11)  Mitelman (CGAP) Follicular lymphoma  
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      Mitelmant(11;12)(q11;q11)  Mitelman (CGAP)LungSquamous cell carcinoma  
      Mitelmant(11;14)(q11;q32)  Mitelman (CGAP) Chronic lymphocytic leukemia  
      Mitelmant(11;14)(q11;q32)  Mitelman (CGAP) Multiple myeloma  
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      Mitelmant(2;11)(p24;q11)  Mitelman (CGAP) Follicular lymphoma  
      Mitelmant(9;11)(q34;q11)  Mitelman (CGAP) Chronic myeloid leukemia, aberrant translocation  
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    8p1211q11Cosmic_SVu(8;11)(p12;q11)  Cosmic_SV [COST221000]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU382]
    8p1211q11Cosmic_SVu(8;11)(p12;q11)  Cosmic_SV [COST341009]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU382]
    8p1211q11Cosmic_SVu(8;11)(p12;q11)  Cosmic_SV [COST372253]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU382]
    8q1211q11Cosmic_SVu(8;11)(q12;q11)  Cosmic_SV [COST318843]breast__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU652]

    Genes in band 11q11

    (click on headers to reorder columns)
    GoldenPath hg38Band 1Band 2ClassCloneFusionPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphologyPubmedOmimAccession
    chr11:54603069-54603998 - 11q11   Gene [G]     OR4C46   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr11:54706832-54707902 + 11q11   Gene [G]     OR4A5   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr11:55262182-55271119 + 11q11   Gene [G]     TRIM48   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr11:55262182-55271119 + 11q11 5p15 Gene [GDB]   TRIM48/ADAMTS16 TRIM48 ADAMTS16 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr11:55262182-55271119 + 11q11 5p15 Gene [M]   TRIM48/ADAMTS16 TRIM48 ADAMTS16 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Skin Malignant melanoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr11:55293703-55298232 - 11q11   Gene [G]     TRIM51HP       [Omim] [Entrez]
    chr11:55343201-55344187 + 11q11   Gene [G]     OR4A16   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr11:55367884-55368918 + 11q11   Gene [G]     OR4A15   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr11:55554307-55555419 + 11q11   Gene [G]     OR4C15   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr11:55572128-55573060 + 11q11   Gene [G]     OR4C16   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr11:55603354-55604398 - 11q11   Gene [G]     OR4C11   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr11:55638358-55639296 + 11q11   Gene [G]     OR4P4   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr11:55650904-55651839 + 11q11   Gene [G]     OR4S2   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr11:55665167-55666096 + 11q11   Gene [G]     OR4C6   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr11:55773438-55774382 + 11q11   Gene [G]     OR5D13   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr11:55795556-55796500 + 11q11   Gene [G]     OR5D14   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]

    [ Bold normal : A; Italic normal :G; Italic small : E ]

    X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22
    [previous]   11 11p 11q 11p15 11p14 11p13 11p12 11p11 11q11 11q12 11q13 11q14 11q21 11q22 11q23 11q24 11q25   [next]

    External links

    Mitelman Database [NCI] : Breakpoint 11q11

    [ UCSC ][ enSembl ][ MapView - NCBI ][ 1000Genomes ][ EVS ][ CGWB ][ DGV ][ DBVar ][ OMIM ][ HapMap ][ DECIPHER ] [ ECARUCA ]
    Gene Expression (MSigDB) in 11q11  [ HTC ]  [ NCI ]  [ INV ]

    Global tables

  • Anomalies list (tabulated txt file)
  • Genes list (tabulated txt file)
  • Anomalies list - limited to abnormalities with gene fusions(tabulated txt file)
  • Genes list - limited to genes fusions (tabulated txt file)
  • list of gene fusions for each gene (with origins of the data)
  • list of gene fusions by origin (with topography and morphology)

    References

    Contributor(s)

    Writtenmay 2012Philippe Dessen
      
    Updatedoct. 2019Philippe Dessen and Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P and Huret JL. Chromosomal band 11q11. Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. July 2012.
    URL : http://atlasgeneticsoncology.org/Bands/11q11.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : lun. oct. 28 16:32:55 CET 2019

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