Chromosome 15

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology

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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 NA

ENTITIES: by Chromosome band

X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 15


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Band 15q11

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  • Chromosomal abnormalities in band 15q11
  • Genes in band 15q11 (reference hg38)
  • External links
  • References

    Chromosomal abnormalities in band 15q11

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    Band 1Band 2ClassEntityPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphology[PubMed][Study]
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    15q1115q13dbCRIDdel(15)(q11q13)NM_004667.4 10922Prader-Willi Syndrome[PubMed] 
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    15q1115q15dbCRIDdel(15)(q11q15) 10643Chronic Lymphoblastic Leukemia[PubMed] 
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      Mitelmandel(15)(q11q21)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloblastic leukemia without maturation (FAB type M1)  
      Mitelmandel(15)(q11q21)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myelomonocytic leukemia (FAB type M4)  
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      Mitelmander(6)t(6;15)(q11;q11)  Mitelman (ISB-CGC) Follicular lymphoma  
      Mitelmander(X)t(X;15)(p11;q11)  Mitelman (ISB-CGC)Soft tissueSynovial sarcoma  
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    Genes in band 15q11

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    GoldenPath hg38Band 1Band 2ClassCloneFusionPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphologyPubmedOmimAccession
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    chr15:22479153-22482374 - 15q11   Gene [G]     HERC2P7       [Omim] [Entrez]
    chr15:22494837-22590831 + 15q11   Gene [FC]   HERC2P2/AK300387 HERC2P2 AK300387 [FusCancer]   Neuroblastoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:22494837-22590831 + 15q11 15q11 Gene [FC]   HERC2/HERC2P2 HERC2P2 HERC2 [FusCancer]   Chronic myelogenous leukemia|Melanoma|Neuroblastoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:22494837-22590831 + 15q11   Gene [G]     HERC2P2       [Omim] [Entrez]
    chr15:22494837-22590831 + 15q11 7q21 Gene [GDB]   HERC2P2/CACNA2D1 HERC2P2 CACNA2D1 [FusionGDB]       [Omim] [Entrez]
    chr15:22494851-22579725 + 15q11 15q13 Gene [AM]   HERC2P10/HERC2 HERC2 HERC2P10 [Cosmic]
    		 [TCGA-BRCA]     [Omim] [Entrez]
    chr15:22494851-22579725 + 15q11 12q24 Gene [CT]   SLC15A4/HERC2 HERC2 SLC15A4 [Cosmic]
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    chr15:22494851-22579725 + 15q11 1q42 Gene [CT]   HERC2/TBCE HERC2 TBCE [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr15:22494851-22579725 + 15q11 15q11 Gene [FC]   HERC2/HERC2P2 HERC2 HERC2P2 [Cosmic]
    [FusCancer]      		 Chronic myelogenous leukemia|Melanoma|Neuroblastoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:22494851-22579725 + 15q11   Gene [FC]   HERC2/HERC2P3 HERC2 HERC2P3 [Cosmic]
    [FusCancer]      		 Cervical cancer|Chronic myelogenous leukemia|Hepatocellular cancer|Neuroblastoma|Neuroblastoma|Neuroblastoma|Chronic myelogenous leukemia [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:22494851-22579725 + 15q11   Gene [G]     HERC2   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr15:22494851-22579725 + 15q11 12q13 Gene [GDB]   HERC2/IGFBP6 HERC2 IGFBP6 [Cosmic]
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    chr15:22494851-22579725 + 15q11 15q12 Gene [GDB]   OCA2/HERC2 HERC2 OCA2 [Cosmic]
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    chr15:22494851-22579725 + 15q11 5q23 Gene [GDB]   HERC2/SLC12A2 HERC2 SLC12A2 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:22494851-22579725 + 15q11 12q24 Gene [GDB]   SLC15A4/HERC2 HERC2 SLC15A4 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:22494851-22579725 + 15q11 1q42 Gene [GDB]   HERC2/TBCE HERC2 TBCE [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:22494851-22579725 + 15q11 19q13 Gene [GDB]   HERC2/TMEM145 HERC2 TMEM145 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:22494851-22579725 + 15q11 3p22 Gene [GDB]   WDR48/HERC2 HERC2 WDR48 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:22494851-22579725 + 15q11 15q12 Gene [H3]   OCA2/HERC2 HERC2 OCA2 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:22494851-22579725 + 15q11 15q12 Gene [H3]   OCA2/HERC2 HERC2 OCA2 [Cosmic] melanoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:22494851-22579725 + 15q11 15q12 Gene [H4]   OCA2/HERC2 HERC2 OCA2 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr15:22494851-22579725 + 15q11 12q13 Gene [M]   HERC2/IGFBP6 HERC2 IGFBP6 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Skin Malignant melanoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:22494851-22579725 + 15q11 5q23 Gene [M]   HERC2/SLC12A2 HERC2 SLC12A2 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Large intestine Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:22494851-22579725 + 15q11 19q13 Gene [M]   HERC2/TMEM145 HERC2 TMEM145 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:22494851-22579725 + 15q11 3p22 Gene [M]   WDR48/HERC2 HERC2 WDR48 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Bladder Transitional cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:22604338-22617854 - 15q11   Gene [G]     GOLGA8J   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr15:22610353-22617854 - 15q11   Gene [G]     GOLGA8IP       [Omim] [Entrez]
    chr15:22664739-22685367 + 15q11   Gene [G]     WHAMMP3       [Omim] [Entrez]
    chr15:22757857-22778737 + 15q11   Gene [G]     LOC283683       [Omim] [Entrez]
    chr15:22767637-22776132 - 15q11   Gene [G]     GOLGA6L7   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr15:22786644-22829789 + 15q11 11p15 Gene [CT]   NIPA1/SMPD1 NIPA1 SMPD1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr15:22786644-22829789 + 15q11   Gene [G]     NIPA1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr15:22786644-22829789 + 15q11 11p15 Gene [GDB]   NIPA1/SMPD1 NIPA1 SMPD1 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:22786644-22829789 + 15q11 15q21 Gene [GDB]   TCF12/NIPA1 NIPA1 TCF12 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:22786644-22829789 + 15q11 15q21 Gene [M]   TCF12/NIPA1 NIPA1 TCF12 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:22838641-22868384 + 15q11   Gene [G]     NIPA2   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr15:22838641-22868384 + 15q11 17q22 Gene [GDB]   STXBP4/NIPA2 NIPA2 STXBP4 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:22838641-22868384 + 15q11 17q22 Gene [M]   STXBP4/NIPA2 NIPA2 STXBP4 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:22867053-22980368 - 15q11 3q22 Gene [AM]   CYFIP1/ACP3 CYFIP1 ACP3 [Cosmic]
    		 [TCGA-PRAD]     [Omim] [Entrez]
    chr15:22867053-22980368 - 15q11 17q21 Gene [CT]   ACSF2/CYFIP1 CYFIP1 ACSF2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr15:22867053-22980368 - 15q11 15q21 Gene [CT]   CYP19A1/CYFIP1 CYFIP1 CYP19A1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr15:22867053-22980368 - 15q11 1p36 Gene [CT]   CYFIP1/UBR4 CYFIP1 UBR4 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr15:22867053-22980368 - 15q11   Gene [G]     CYFIP1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr15:22867053-22980368 - 15q11 17q12 Gene [GDB]   CYFIP1/ACACA CYFIP1 ACACA [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:22867053-22980368 - 15q11 17q21 Gene [GDB]   ACSF2/CYFIP1 CYFIP1 ACSF2 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:22867053-22980368 - 15q11 16q22 Gene [GDB]   CIAO2B/CYFIP1 CYFIP1 CIAO2B [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:22867053-22980368 - 15q11 15q21 Gene [GDB]   CYP19A1/CYFIP1 CYFIP1 CYP19A1 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:22867053-22980368 - 15q11 15q13 Gene [GDB]   CYFIP1/FAM189A1 CYFIP1 FAM189A1 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:22867053-22980368 - 15q11 15q11 Gene [GDB]   CYFIP1/SNHG14 CYFIP1 SNHG14 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:22867053-22980368 - 15q11 15q11 Gene [GDB]   SNRPN/CYFIP1 CYFIP1 SNRPN [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:22867053-22980368 - 15q11 15q21 Gene [GDB]   TEX9/CYFIP1 CYFIP1 TEX9 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:22867053-22980368 - 15q11 15q11 Gene [GDB]   CYFIP1/TUBGCP5 CYFIP1 TUBGCP5 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:22867053-22980368 - 15q11 1p36 Gene [GDB]   CYFIP1/UBR4 CYFIP1 UBR4 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:22867053-22980368 - 15q11 20q13 Gene [GDB]   CYFIP1/ZNFX1 CYFIP1 ZNFX1 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:22867053-22980368 - 15q11 17q12 Gene [M]   CYFIP1/ACACA CYFIP1 ACACA [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:22867053-22980368 - 15q11 16q22 Gene [M]   CIAO2B/CYFIP1 CYFIP1 CIAO2B [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Adrenal Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:22867053-22980368 - 15q11 15q13 Gene [M]   CYFIP1/FAM189A1 CYFIP1 FAM189A1 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:22867053-22980368 - 15q11 15q11 Gene [M]   SNRPN/CYFIP1 CYFIP1 SNRPN [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Brain Astrocytoma, grade I-II [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:22867053-22980368 - 15q11 15q21 Gene [M]   TEX9/CYFIP1 CYFIP1 TEX9 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:22867053-22980368 - 15q11 15q11 Gene [M]   CYFIP1/TUBGCP5 CYFIP1 TUBGCP5 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:22867053-22980368 - 15q11 20q13 Gene [M]   CYFIP1/ZNFX1 CYFIP1 ZNFX1 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Skin Malignant melanoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:22867053-22980368 - 15q11   Gene [PC]   RP11-128A17.1/CYFIP1 CYFIP1 RP11-128A17.1 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:22867053-22980368 - 15q11 15q21 Gene [TF]   TEX9/CYFIP1 CYFIP1 TEX9 [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:22867053-22980368 - 15q11 15q11 Gene [TF]   CYFIP1/TUBGCP5 CYFIP1 TUBGCP5 [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-BLCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:22867053-22980368 - 15q11 15q11 Gene [TF]   CYFIP1/TUBGCP5 CYFIP1 TUBGCP5 [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:22999177-23039569 - 15q11 6q12 Gene [CT]   ADGRB3/TUBGCP5 TUBGCP5 ADGRB3 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr15:22999177-23039569 - 15q11   Gene [G]     TUBGCP5       [Omim] [Entrez]
    chr15:22999177-23039569 - 15q11 15q11 Gene [GDB]   CYFIP1/TUBGCP5 TUBGCP5 CYFIP1 [FusionGDB]       [Omim] [Entrez]
    chr15:22999177-23039569 - 15q11 8p11 Gene [GDB]   TUBGCP5/KCNU1 TUBGCP5 KCNU1 [FusionGDB]       [Omim] [Entrez]
    chr15:22999177-23039569 - 15q11 1p32 Gene [GDB]   TUBGCP5/TUT4 TUBGCP5 TUT4 [FusionGDB]       [Omim] [Entrez]
    chr15:22999177-23039569 - 15q11 15q11 Gene [M]   CYFIP1/TUBGCP5 TUBGCP5 CYFIP1 [Mitelman] Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:22999177-23039569 - 15q11 8p11 Gene [M]   TUBGCP5/KCNU1 TUBGCP5 KCNU1 [Mitelman] Large intestine Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:22999177-23039569 - 15q11 1p32 Gene [M]   TUBGCP5/TUT4 TUBGCP5 TUT4 [Mitelman] Unknown site Mesenchymal tumor, NOS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:22999177-23039569 - 15q11 15q11 Gene [TF]   CYFIP1/TUBGCP5 TUBGCP5 CYFIP1 [TCGA] [TCGA-BLCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:22999177-23039569 - 15q11 15q11 Gene [TF]   CYFIP1/TUBGCP5 TUBGCP5 CYFIP1 [TCGA] [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:23127066-23136822 - 15q11   Gene [G]     GOLGA6L1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr15:23127066-23334210 - 15q11   Gene [G]     GOLGA6L22   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr15:23157340-23170783 + 15q11   Gene [G]     GOLGA8DP       [Omim] [Entrez]
    chr15:23288014-23303510 - 15q11   Gene [E]     LOC102723534       [Omim] [Entrez]
    chr15:23311345-23314528 + 15q11   Gene [G]     HERC2P11       [Omim] [Entrez]
    chr15:23354748-23368454 + 15q11   Gene [G]     GOLGA8S   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr15:23354753-23368395 + 15q11   Gene [G]     GOLGA8H   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
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    chr15:23439038-23447243 - 15q11 16p13 Gene [GDB]   CREBBP/GOLGA6L2 GOLGA6L2 CREBBP [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:23439038-23447243 - 15q11 16p13 Gene [M]   CREBBP/GOLGA6L2 GOLGA6L2 CREBBP [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Brain Astrocytoma, grade I-II [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:23562062-23562131 - 15q11   Gene [G]     MIR4508       [Omim] [Entrez]
    chr15:23565674-23568044 + 15q11   Gene [G]     MKRN3   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr15:23643549-23647867 - 15q11   Gene [G]     MAGEL2   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr15:23685400-23687305 - 15q11   Gene [G]     NDN   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr15:23975147-24088154 + 15q11   Gene [G]     PWRN4       [Omim] [Entrez]
    chr15:24164777-24169948 - 15q11   Gene [G]     PWRN2       [Omim] [Entrez]
    chr15:24441127-24447967 + 15q11   Gene [G]     PWRN3       [Omim] [Entrez]
    chr15:24558157-24587779 + 15q11 15q21 Gene [CT]   ATP8B4/PWRN1 PWRN1 ATP8B4 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr15:24558157-24587779 + 15q11 7q34 Gene [CT]   PWRN1/UBN2 PWRN1 UBN2 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr15:24558157-24587779 + 15q11   Gene [G]     PWRN1       [Omim] [Entrez]
    chr15:24558157-24587779 + 15q11 15q21 Gene [GDB]   ATP8B4/PWRN1 PWRN1 ATP8B4 [FusionGDB]       [Omim] [Entrez]
    chr15:24558157-24587779 + 15q11 7q34 Gene [GDB]   PWRN1/UBN2 PWRN1 UBN2 [FusionGDB]       [Omim] [Entrez]
    chr15:24675775-24683392 + 15q11   Gene [G]     NPAP1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-25419461 + 15q11 15q11 Gene [DDG]   SNHG14/SNURF SNHG14 SNURF [GTEx_BRAIN]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-25419461 + 15q11   Gene [G]     SNHG14       [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-25419461 + 15q11 15q11 Gene [GDB]   CYFIP1/SNHG14 SNHG14 CYFIP1 [FusionGDB]       [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-25419461 + 15q11 17q12 Gene [GDB]   FBXL20/SNHG14 SNHG14 FBXL20 [FusionGDB]       [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-25419461 + 15q11 Xp11 Gene [GDB]   SNHG14/FUNDC1 SNHG14 FUNDC1 [FusionGDB]       [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-25419461 + 15q11 15q12 Gene [GDB]   GABRG3/SNHG14 SNHG14 GABRG3 [FusionGDB]       [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-25419461 + 15q11 17q12 Gene [GDB]   SNHG14/STARD3 SNHG14 STARD3 [FusionGDB]       [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 15q12 Gene [K]   SNRPN/GABRB3 SNRPN GABRB3 [Cosmic] Angelman Syndrome [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 13q34 Gene [CT]   SNRPN/ARHGEF7 SNRPN ARHGEF7 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 2q35 Gene [CT]   SNRPN/ARPC2 SNRPN ARPC2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 18q12 Gene [CT]   SNRPN/DTNA SNRPN DTNA [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 19q13 Gene [CT]   SNRPN/LENG8 SNRPN LENG8 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 2q31 Gene [CT]   LOC101926913/SNRPN SNRPN LOC101926913 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 12q24 Gene [CT]   MYL2/SNRPN SNRPN MYL2 [Cosmic]
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    chr15:24823608-24978723 + 15q11 12p13 Gene [CT]   NOP2/SNRPN SNRPN NOP2 [Cosmic]
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    chr15:24823608-24978723 + 15q11 8p22 Gene [CT]   PSD3/SNRPN SNRPN PSD3 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 6p24 Gene [CT]   SNRPN/RREB1 SNRPN RREB1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 20p12 Gene [CT]   SNRPN/SNAP25 SNRPN SNAP25 [Cosmic]
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    chr15:24823608-24978723 + 15q11 15q11 Gene [CT]   SNRPN/SNRPN SNRPN SNRPN [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 15q11 Gene [CT]   SNRPN/SNRPN SNRPN SNRPN [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
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    chr15:24823608-24978723 + 15q11 15q11 Gene [CT]   SNRPN/SNRPN SNRPN SNRPN [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 19p13 Gene [CT]   SNRPN/SUGP1 SNRPN SUGP1 [Cosmic]
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    chr15:24823608-24978723 + 15q11 13q12 Gene [CT]   TEX26/SNRPN SNRPN TEX26 [Cosmic]
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    chr15:24823608-24978723 + 15q11 12q13 Gene [CT]   SNRPN/TUBA1B SNRPN TUBA1B [Cosmic]
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    chr15:24823608-24978723 + 15q11 19q13 Gene [CT]   ZNF329/SNRPN SNRPN ZNF329 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11   Gene [DDG]   AC124312.1/SNRPN SNRPN AC124312.1 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 15q11 Gene [DDG]   SNURF/SNRPN SNRPN SNURF [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11   Gene [G]     SNRPN   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 13q34 Gene [GDB]   SNRPN/ARHGEF7 SNRPN ARHGEF7 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 2q35 Gene [GDB]   SNRPN/ARPC2 SNRPN ARPC2 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 15q11 Gene [GDB]   SNRPN/CYFIP1 SNRPN CYFIP1 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 18q12 Gene [GDB]   SNRPN/DTNA SNRPN DTNA [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 15q13 Gene [GDB]   FMN1/SNRPN SNRPN FMN1 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 19q13 Gene [GDB]   SNRPN/LENG8 SNRPN LENG8 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 12q24 Gene [GDB]   MYL2/SNRPN SNRPN MYL2 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 12p13 Gene [GDB]   NOP2/SNRPN SNRPN NOP2 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 8p22 Gene [GDB]   PSD3/SNRPN SNRPN PSD3 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 6p24 Gene [GDB]   SNRPN/RREB1 SNRPN RREB1 [Cosmic]
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    chr15:24823608-24978723 + 15q11 20p12 Gene [GDB]   SNRPN/SNAP25 SNRPN SNAP25 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 15q11 Gene [GDB]   SNRPN/SNRPN SNRPN SNRPN [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 19p13 Gene [GDB]   SNRPN/SUGP1 SNRPN SUGP1 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 13q12 Gene [GDB]   TEX26/SNRPN SNRPN TEX26 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 12q13 Gene [GDB]   SNRPN/TUBA1B SNRPN TUBA1B [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 19q13 Gene [GDB]   ZNF329/SNRPN SNRPN ZNF329 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 15q24 Gene [H3]   SNRPN/PML SNRPN PML [Cosmic] Prader Willi syndrome [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 15q11 Gene [H3]   UBE3A/SNRPN SNRPN UBE3A [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 15q11 Gene [H3]   UBE3A/SNRPN SNRPN UBE3A [Cosmic] angelman syndrome;Prader Willi syndrome [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 15q24 Gene [H4]   SNRPN/PML SNRPN PML [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 15q11 Gene [H4]   UBE3A/SNRPN SNRPN UBE3A [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 15q11 Gene [M]   SNRPN/CYFIP1 SNRPN CYFIP1 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Brain Astrocytoma, grade I-II [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:24823608-24978723 + 15q11 15q13 Gene [M]   FMN1/SNRPN SNRPN FMN1 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:24954987-24968821 + 15q11 15q11 Gene [DDG]   SNHG14/SNURF SNURF SNHG14 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:24954987-24968821 + 15q11 15q11 Gene [DDG]   SNURF/SNRPN SNURF SNRPN [Cosmic] [GTEx_BRAIN]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:24954987-24968821 + 15q11   Gene [G]     SNURF   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr15:24981994-24983790 + 15q11   Gene [G]     PWARSN       [Omim] [Entrez]
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    chr15:24984860-24988232 + 15q11   Gene [G]     PWAR5       [Omim] [Entrez]
    chr15:24985100-24985166 + 15q11   Gene [G]     SNORD64       [Omim] [Entrez]
    chr15:24986925-24986993 + 15q11   Gene [G]     SNORD108       [Omim] [Entrez]
    chr15:25031873-25036488 + 15q11   Gene [G]     PWAR6       [Omim] [Entrez]
    chr15:25041974-25042040 + 15q11   Gene [G]     SNORD109A       [Omim] [Entrez]
    chr15:25041974-25042040 + 15q11   Gene [G]     SNORD109B       [Omim] [Entrez]
    chr15:25116545-25122476 + 15q11   Gene [G]     IPW       [Omim] [Entrez]
    chr15:25135642-25138053 + 15q11   Gene [G]     PWAR1       [Omim] [Entrez]
    chr15:25211692-25212033 + 15q11   Gene [G]     PWAR4       [Omim] [Entrez]
    chr15:25333728-25439024 - 15q11 11q14 Gene [AM]   UBE3A/DISC1FP1 UBE3A DISC1FP1 [Cosmic]
    		 [TCGA-LUSC]     [Omim] [Entrez]
    chr15:25333728-25439024 - 15q11 12q13 Gene [GDB]   CDK2/UBE3A UBE3A CDK2 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
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    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:25333728-25439024 - 15q11 11q14 Gene [GDB]   UBE3A/DISC1FP1 UBE3A DISC1FP1 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:25333728-25439024 - 15q11 15q21 Gene [GDB]   UBE3A/DTWD1 UBE3A DTWD1 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:25333728-25439024 - 15q11 15q21 Gene [GDB]   UBE3A/MYO5C UBE3A MYO5C [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr15:25333728-25439024 - 15q11 15q11 Gene [H3]   UBE3A/SNRPN UBE3A SNRPN [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:25333728-25439024 - 15q11 15q11 Gene [H3]   UBE3A/SNRPN UBE3A SNRPN [Cosmic] angelman syndrome;Prader Willi syndrome [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:25333728-25439024 - 15q11 15q11 Gene [H4]   UBE3A/SNRPN UBE3A SNRPN [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr15:25333728-25439024 - 15q11 12q13 Gene [M]   CDK2/UBE3A UBE3A CDK2 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Skin Malignant melanoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr15:25333728-25439024 - 15q11 15q21 Gene [M]   UBE3A/CYP19A1 UBE3A CYP19A1 [Cosmic]
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    chr15:25333728-25439024 - 15q11 15q21 Gene [M]   UBE3A/DTWD1 UBE3A DTWD1 [Cosmic]
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    chr15:25333728-25439024 - 15q11   Gene [A]     UBE3A   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]

    [ Bold normal : A; Italic normal :G; Italic small : E ]

    X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22
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    External links

    Mitelman Database [NCI] : Breakpoint 15q11

    [ UCSC ][ enSembl ][ MapView - NCBI ][ 1000Genomes ][ EVS ][ CGWB ][ DGV ][ DBVar ][ OMIM ][ HapMap ][ DECIPHER ] [ ECARUCA ]
    Gene Expression (MSigDB) in 15q11  [ HTC ]  [ NCI ]  [ INV ]

    Global tables

  • Anomalies list (tabulated txt file)
  • Genes list (tabulated txt file)
  • Anomalies list - limited to abnormalities with gene fusions(tabulated txt file)
  • Genes list - limited to genes fusions (tabulated txt file)
  • list of gene fusions for each gene (with origins of the data)
  • list of gene fusions by origin (with topography and morphology)

    References

    Contributor(s)

    Writtenmay 2012Philippe Dessen
      
    Updatedfevr. 2021Philippe Dessen and Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P and Huret JL. Chromosomal band 15q11. Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. July 2012.
    URL : http://atlasgeneticsoncology.org/Bands/15q11.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : sam. fevr. 20 15:35:35 CET 2021

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