Chromosome 20

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology

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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 NA

ENTITIES: by Chromosome band

X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 20


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Band 20q12

chr20:39000000-43100000 (4100 Kb)

  • Chromosomal abnormalities in band 20q12
  • Genes in band 20q12 (reference hg38)
  • External links
  • References

    Chromosomal abnormalities in band 20q12

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    Band 1Band 2ClassEntityPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphology[PubMed][Study]
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      Mitelmandel(20)(q11q12)  Mitelman (CGAP) Acute myeloblastic leukemia without maturation (FAB type M1)  
      Mitelmandel(20)(q11q12)  Mitelman (CGAP) Acute myeloid leukemia, NOS  
      Mitelmandel(20)(q11q12)  Mitelman (CGAP) Chronic eosinophilic leukemia/hypereosinophilic syndrome  
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      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (CGAP) Acute erythroleukemia (FAB type M6)  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (CGAP) Acute megakaryoblastic leukemia (FAB type M7)  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (CGAP) Acute monoblastic leukemia without differentiation (FAB type M5a)  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (CGAP) Acute myeloblastic leukemia with minimal differentiation (FAB type M0)  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (CGAP) Acute myeloblastic leukemia without maturation (FAB type M1)  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (CGAP) Acute myeloid leukemia, NOS  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (CGAP) Acute myelomonocytic leukemia (FAB type M4)  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (CGAP) Acute undifferentiated leukemia  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (CGAP) Chronic lymphocytic leukemia  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (CGAP) Chronic myeloid leukemia, t(9;22)  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (CGAP) Chronic myelomonocytic leukemia  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (CGAP) Chronic myeloproliferative disorder, NOS  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (CGAP) Diffuse large B-cell lymphoma  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (CGAP) Essential thrombocythemia  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (CGAP) Idiopathic myelofibrosis  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (CGAP) Multiple myeloma  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (CGAP) Myelodysplastic/myeloproliferative disease, NOS  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (CGAP) Myelodysplastic syndrome, NOS  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (CGAP) Polycythemia vera  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (CGAP) Refractory anemia  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (CGAP) Refractory anemia with excess blasts-1  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (CGAP) Refractory anemia with excess blasts-2  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (CGAP) Refractory anemia with excess of blasts (FAB)  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (CGAP) Refractory anemia with ringed sideroblasts  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (CGAP) Refractory cytopenia with multilineage dysplasia  
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      Mitelmandel(20)(q12q13)  Mitelman (CGAP) Acute myeloid leukemia, NOS  
      Mitelmandel(20)(q12q13)  Mitelman (CGAP) Refractory anemia  
      Mitelmandel(20)(q12q13)  Mitelman (CGAP) Refractory anemia with excess of blasts (FAB)  
      Mitelmandel(20)(q12q13)  Mitelman (CGAP) Refractory anemia with ringed sideroblasts  
    11p1520q12dbCRIDder(11)t(11;20)(p15;q12)NUP98/TOP1 11581T-Cell Myelodysplastic Syndrome[PubMed] 
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      Mitelmandic(8;20)(p11;q12)  Mitelman (CGAP) Myelodysplastic syndrome, NOS  
    20p1120q12Cosmic_SVdup(20)(p11q12)  Cosmic_SV [COST164384]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
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    20q1220q12Cosmic_SVinv(20)(q12q12)  Cosmic_SV [COST193493]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU328]
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    Genes in band 20q12

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    chr20:40685848-40689240 - 20q12 3p22 Gene [CT]   MAFB/WDR48 MAFB WDR48 [Cosmic]
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    chr20:40685848-40689240 - 20q12 20q13 Gene [CT]   ZBTB46/MAFB MAFB ZBTB46 [Cosmic]
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    chr20:40685848-40689240 - 20q12 3p22 Gene [GDB]   MAFB/WDR48 MAFB WDR48 [Cosmic]
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    chr20:40685848-40689240 - 20q12 20q13 Gene [GDB]   ZBTB46/MAFB MAFB ZBTB46 [Cosmic]
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    chr20:40685848-40689240 - 20q12   Gene [H2]   MAFB/IGH MAFB IGH [Cosmic] MM   [Omim] [Entrez]
    chr20:40685848-40689240 - 20q12 16q23 Gene [H3]   MAFB/MAF MAFB MAF [Cosmic] multiple myeloma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:40685848-40689240 - 20q12 16q23 Gene [H3]   MAFB/MAF MAFB MAF [Cosmic] multiple myeloma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:40685848-40689240 - 20q12 16q23 Gene [H3]   MAFB/MAF MAFB MAF [Cosmic] plasma cell leukemia [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:40685848-40689240 - 20q12 16q23 Gene [H3]   MAFB/MAF MAFB MAF [Cosmic] multiple myeloma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:40685848-40689240 - 20q12 16q23 Gene [H3]   MAF/MAFB MAFB MAF [Cosmic] multiple myeloma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:40685848-40689240 - 20q12   Gene [A]     MAFB   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
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    chr20:40980713-41025396 + 20q12   Gene [G]     LOC100128988       [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 11p15 Gene [K]   NUP98/TOP1 TOP1 NUP98 [Cosmic] Acute Lymphoblastic Leukemia [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 11p15 Gene [K]   NUP98/TOP1 TOP1 NUP98 [Cosmic] Myelodysplasia Syndrome [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 6q14 Gene [K]   SENP6/TOP1 TOP1 SENP6 [Cosmic] T-Cell Lymphoblastic Lymphoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 11p15 Gene [K]   NUP98/TOP1 TOP1 NUP98 [Cosmic] T-Cell Myelodysplastic Syndrome [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 11p15 Gene [K]   NUP98/TOP1 TOP1 NUP98 [Cosmic] Acute Myelocytic Leukemia-M2 [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr20:41028818-41124486 + 20q12 11p15 Gene [H2]   NUP98/TOP1 TOP1 NUP98 [Cosmic] acute monocytic leukemia [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 11p15 Gene [H2]   NUP98/TOP1 TOP1 NUP98 [Cosmic] de novo acute myeloid leukemia [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 11p15 Gene [H2]   NUP98/TOP1 TOP1 NUP98 [Cosmic] therapy -related myelodysplastic syndrome [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 11p15 Gene [H2]   NUP98/TOP1 TOP1 NUP98 [Cosmic] acute myelogenous leukemia or myelodysplastic syndrome (tAML/MDS) [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 11p15 Gene [H2]   NUP98/TOP1 TOP1 NUP98 [Cosmic] acute myeloid leukemia [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 11p15 Gene [H2]   NUP98/TOP1 TOP1 NUP98 [Cosmic] acute myeloid leukemia [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr20:41028818-41124486 + 20q12 11p15 Gene [H2]   NUP98/TOP1 TOP1 NUP98 [Cosmic] acute Myelogenous leukemia [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr20:41028818-41124486 + 20q12 11p15 Gene [H2]   TOP1/NUP98 TOP1 NUP98 [Cosmic] therapy -related myelodysplastic syndrome [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr20:41028818-41124486 + 20q12 11p15 Gene [H3]   TOP1/NUP98 TOP1 NUP98 [Cosmic] acute myeloid leukemia;myeloid leukemia;leukemia [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr20:41028818-41124486 + 20q12 11p15 Gene [H3]   TOP1/NUP98 TOP1 NUP98 [Cosmic] acute myeloid leukemia;myelodysplastic syndrome;leukemia;polycythemia vera [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 11p15 Gene [H3]   TOP1/NUP98 TOP1 NUP98 [Cosmic] myelodysplastic syndrome;leukemia [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 4q26 Gene [MAY]   CAMK2D/TOP1 TOP1 CAMK2D [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 17q23 Gene [M]   TOP1/C17orf64 TOP1 C17orf64 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 20q13 Gene [M]   TOP1/CDH4 TOP1 CDH4 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 11q14 Gene [M]   NARS2/TOP1 TOP1 NARS2 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 11p15 Gene [M]   NUP98/TOP1 TOP1 NUP98 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Acute monoblastic leukemia (FAB type M5) [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 11p15 Gene [M]   NUP98/TOP1 TOP1 NUP98 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Acute monoblastic leukemia with differentiation (FAB type M5b) [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 11p15 Gene [M]   NUP98/TOP1 TOP1 NUP98 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2) [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 11p15 Gene [M]   NUP98/TOP1 TOP1 NUP98 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Acute myeloblastic leukemia without maturation (FAB type M1) [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 11p15 Gene [M]   NUP98/TOP1 TOP1 NUP98 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Acute myeloid leukemia, NOS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 11p15 Gene [M]   NUP98/TOP1 TOP1 NUP98 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Acute myelomonocytic leukemia (FAB type M4) [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 11p15 Gene [M]   NUP98/TOP1 TOP1 NUP98 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Refractory anemia with excess of blasts (FAB) [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 12p13 Gene [M]   TOP1/PZP TOP1 PZP [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 20q13 Gene [M]   TOP1/SLC2A10 TOP1 SLC2A10 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 11p15 Gene [PM]   NUP98/TOP1 TOP1 NUP98 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 11p15 Gene [PM]   NUP98/TOP1 TOP1 NUP98 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 11p15 Gene [PM]   NUP98/TOP1 TOP1 NUP98 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 11p15 Gene [PM]   NUP98/TOP1 TOP1 NUP98 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 11p15 Gene [S]   NUP98/TOP1 TOP1 NUP98 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 17q23 Gene [TF]   TOP1/C17orf64 TOP1 C17orf64 [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 20q13 Gene [TF]   TOP1/CDH4 TOP1 CDH4 [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 12p13 Gene [TF]   TOP1/PZP TOP1 PZP [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12 11p15 Gene [TIC]   NUP98/TOP1 TOP1 NUP98 [Cosmic]
    [TICdb]    		   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028818-41124486 + 20q12   Gene [A]     TOP1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr20:41097994-41138000 - 20q12 20q12 Gene [AM]   ZHX3/PLCG1-AS1 PLCG1-AS1 ZHX3     [Omim] [Entrez]
    chr20:41097994-41138000 - 20q12   Gene [G]     PLCG1-AS1       [Omim] [Entrez]
    chr20:41137521-41175717 + 20q12   Gene [CEN]   PLCG1/fusion PLCG1 fusion [Cosmic]
    [Census]    		     [Omim] [Entrez]
    chr20:41137521-41175717 + 20q12 6q25 Gene [CT]   ARID1B/PLCG1 PLCG1 ARID1B [Cosmic]
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    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr20:41137521-41175717 + 20q12 19q13 Gene [CT]   MYH14/PLCG1 PLCG1 MYH14 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
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    chr20:41137521-41175717 + 20q12 2q22 Gene [CT]   ZEB2/PLCG1 PLCG1 ZEB2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr20:41137521-41175717 + 20q12 6q25 Gene [GDB]   ARID1B/PLCG1 PLCG1 ARID1B [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:41137521-41175717 + 20q12 20q11 Gene [GDB]   PLCG1/BPIFB1 PLCG1 BPIFB1 [Cosmic]
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    chr20:41137521-41175717 + 20q12 20q13 Gene [GDB]   PLCG1/EYA2 PLCG1 EYA2 [Cosmic]
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    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:41137521-41175717 + 20q12 19q13 Gene [GDB]   MYH14/PLCG1 PLCG1 MYH14 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:41137521-41175717 + 20q12 20q13 Gene [GDB]   PLCG1/TAF4 PLCG1 TAF4 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:41137521-41175717 + 20q12 20q11 Gene [GDB]   TRPC4AP/PLCG1 PLCG1 TRPC4AP [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:41137521-41175717 + 20q12 6p21 Gene [GDB]   ZBTB22/PLCG1 PLCG1 ZBTB22 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:41137521-41175717 + 20q12 2q22 Gene [GDB]   ZEB2/PLCG1 PLCG1 ZEB2 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:41137521-41175717 + 20q12 4q12 Gene [H3]   PLCG1/KDR PLCG1 KDR [Cosmic] angiosarcoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41137521-41175717 + 20q12 20q11 Gene [M]   PLCG1/BPIFB1 PLCG1 BPIFB1 [Cosmic]
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    chr20:41137521-41175717 + 20q12 20q13 Gene [M]   PLCG1/EYA2 PLCG1 EYA2 [Cosmic]
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    chr20:41137521-41175717 + 20q12 20q13 Gene [M]   PLCG1/TAF4 PLCG1 TAF4 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr20:41137521-41175717 + 20q12   Gene [PM]   / PLCG1   [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41137521-41175717 + 20q12 16q22 Gene [PM]   PLCG1/TAT PLCG1 TAT [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41137521-41175717 + 20q12 20q11 Gene [TF]   PLCG1/BPIFB1 PLCG1 BPIFB1 [Cosmic]
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    chr20:41137521-41175717 + 20q12 20q13 Gene [TF]   PLCG1/TAF4 PLCG1 TAF4 [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41169023-41169078 + 20q12   Gene [G]     MIR6871       [Omim] [Entrez]
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    chr20:41178449-41300099 - 20q12 20q11 Gene [GDB]   ZHX3/VSTM2L ZHX3 VSTM2L [Cosmic]
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    chr20:41178449-41300099 - 20q12 19q13 Gene [M]   ZHX3/SMG9 ZHX3 SMG9 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Pleura Mesothelioma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr20:41359966-41366858 - 20q12 20q13 Gene [M]   PMEPA1/EMILIN3 EMILIN3 PMEPA1 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41359966-41366858 - 20q12 20q13 Gene [TF]   PMEPA1/EMILIN3 EMILIN3 PMEPA1 [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41402103-41618494 - 20q12   Gene [K]   / CHD6   [Cosmic] Mental Retardation Syndrome [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41402103-41618494 - 20q12   Gene [A]     CHD6   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
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    chr20:41402103-41618494 - 20q12   Gene [FM]   CHD6/RP11-80K6.2 CHD6 RP11-80K6.2 [Cosmic] breast HER2 [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41402103-41618494 - 20q12 20p11 Gene [GDB]   CHD6/ABHD12 CHD6 ABHD12 [Cosmic]
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    chr20:41402103-41618494 - 20q12 Xp22 Gene [GDB]   CHD6/P2RY8 CHD6 P2RY8 [Cosmic]
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    chr20:41402103-41618494 - 20q12 20q13 Gene [GDB]   CHD6/SNX21 CHD6 SNX21 [Cosmic]
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    chr20:41402103-41618494 - 20q12 20q12 Gene [GDB]   ZHX3/CHD6 CHD6 ZHX3 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:41402103-41618494 - 20q12 19q13 Gene [GDB]   CHD6/ZNF235 CHD6 ZNF235 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:41402103-41618494 - 20q12 10q25 Gene [H2]   TCF7L2/CHD6 CHD6 TCF7L2 [Cosmic] mentalretardationbut with outtheclassicalPitt-Hopkins syndrome [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41402103-41618494 - 20q12 6q13 Gene [H3]   LMBRD1/CHD6 CHD6 LMBRD1 [Cosmic] acute myeloid leukemia;myeloid leukemia;leukemia [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41402103-41618494 - 20q12 20p11 Gene [M]   CHD6/ABHD12 CHD6 ABHD12 [Cosmic]
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    chr20:41402103-41618494 - 20q12 15q25 Gene [M]   CHD6/CHRNB4 CHD6 CHRNB4 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    [TCGA]    		 [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:42072752-43189917 - 20q12   Gene [CEN]     PTPRT   [Cosmic]
    [Census]    		     [Omim] [Entrez]
    chr20:42072752-43189917 - 20q12 20q12 Gene [CT]   PTPRT/PTPRT PTPRT PTPRT [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr20:42072752-43189917 - 20q12 20q12 Gene [CT]   PTPRT/PTPRT PTPRT PTPRT [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr20:42072752-43189917 - 20q12 12q24 Gene [CT]   PTPRT/ZCCHC8 PTPRT ZCCHC8 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr20:42072752-43189917 - 20q12   Gene [G]     PTPRT   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr20:42072752-43189917 - 20q12 20q12 Gene [GDB]   CHD6/PTPRT PTPRT CHD6 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:42072752-43189917 - 20q12 4q12 Gene [GDB]   DCUN1D4/PTPRT PTPRT DCUN1D4 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:42072752-43189917 - 20q12 14q24 Gene [GDB]   PTPRT/EXD2 PTPRT EXD2 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:42072752-43189917 - 20q12 11q14 Gene [GDB]   GAB2/PTPRT PTPRT GAB2 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:42072752-43189917 - 20q12 11q14 Gene [GDB]   INTS4/PTPRT PTPRT INTS4 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:42072752-43189917 - 20q12 20q13 Gene [GDB]   NCOA3/PTPRT PTPRT NCOA3 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:42072752-43189917 - 20q12 20q13 Gene [GDB]   PTPRT/NCOA3 PTPRT NCOA3 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:42072752-43189917 - 20q12 8q21 Gene [GDB]   PTPRT/OSGIN2 PTPRT OSGIN2 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:42072752-43189917 - 20q12 20q11 Gene [GDB]   PIGU/PTPRT PTPRT PIGU [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:42072752-43189917 - 20q12 20q12 Gene [GDB]   PTPRT/PTPRT PTPRT PTPRT [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:42072752-43189917 - 20q12 20q11 Gene [GDB]   SRC/PTPRT PTPRT SRC [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:42072752-43189917 - 20q12 20q12 Gene [GDB]   TOP1/PTPRT PTPRT TOP1 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:42072752-43189917 - 20q12 12q24 Gene [GDB]   PTPRT/ZCCHC8 PTPRT ZCCHC8 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:42072752-43189917 - 20q12 20q13 Gene [GDB]   ZSWIM3/PTPRT PTPRT ZSWIM3 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:42072752-43189917 - 20q12 14q24 Gene [M]   PTPRT/EXD2 PTPRT EXD2 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:42072752-43189917 - 20q12 11q14 Gene [M]   GAB2/PTPRT PTPRT GAB2 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Skin Malignant melanoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:42072752-43189917 - 20q12 20q13 Gene [M]   NCOA3/PTPRT PTPRT NCOA3 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Unknown site Mesenchymal tumor, NOS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:42072752-43189917 - 20q12 20q13 Gene [M]   PTPRT/NCOA3 PTPRT NCOA3 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:42072752-43189917 - 20q12 20q11 Gene [M]   PIGU/PTPRT PTPRT PIGU [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:42072752-43189917 - 20q12 20q13 Gene [M]   ZSWIM3/PTPRT PTPRT ZSWIM3 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Skin Malignant melanoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:42072752-43189917 - 20q12 20q11 Gene [PM]   RALY/PTPRT PTPRT RALY [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:42072752-43189917 - 20q12 4q21 Gene [PM]   WDFY3/PTPRT PTPRT WDFY3 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:42072752-43189917 - 20q12 14q24 Gene [TF]   PTPRT/EXD2 PTPRT EXD2 [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:42072752-43189917 - 20q12 20q13 Gene [TF]   PTPRT/NCOA3 PTPRT NCOA3 [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:42072752-43189917 - 20q12 20q11 Gene [TF]   PIGU/PTPRT PTPRT PIGU [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:42685483-42688562 + 20q12   Gene [G]     LOC101927159       [Omim] [Entrez]
    chr20:42968743-42971492 + 20q12   Gene [G]     LOC101927138       [Omim] [Entrez]

    [ Bold normal : A; Italic normal :G; Italic small : E ]

    X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22
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    External links

    Mitelman Database [NCI] : Breakpoint 20q12

    [ UCSC ][ enSembl ][ MapView - NCBI ][ 1000Genomes ][ EVS ][ CGWB ][ DGV ][ DBVar ][ OMIM ][ HapMap ][ DECIPHER ] [ ECARUCA ]
    Gene Expression (MSigDB) in 20q12  [ HTC ]  [ NCI ]  [ INV ]

    Global tables

  • Anomalies list (tabulated txt file)
  • Genes list (tabulated txt file)
  • Anomalies list - limited to abnormalities with gene fusions(tabulated txt file)
  • Genes list - limited to genes fusions (tabulated txt file)
  • list of gene fusions for each gene (with origins of the data)
  • list of gene fusions by origin (with topography and morphology)

    References

    Contributor(s)

    Writtenmay 2012Philippe Dessen
      
    Updatedoct. 2019Philippe Dessen and Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P and Huret JL. Chromosomal band 20q12. Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. July 2012.
    URL : http://atlasgeneticsoncology.org/Bands/20q12.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : lun. oct. 28 16:39:18 CET 2019

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