Chromosome 20

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology

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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 NA

ENTITIES: by Chromosome band

X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 20


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Band 20q12

chr20:39000000-43100000 (4100 Kb)

  • Chromosomal abnormalities in band 20q12
  • Genes in band 20q12 (reference hg38)
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    Chromosomal abnormalities in band 20q12

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    Band 1Band 2ClassEntityPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphology[PubMed][Study]
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      Mitelmandel(20)(q11q12)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloblastic leukemia without maturation (FAB type M1)  
      Mitelmandel(20)(q11q12)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloid leukemia, NOS  
      Mitelmandel(20)(q11q12)  Mitelman (ISB-CGC) Chronic eosinophilic leukemia/hypereosinophilic syndrome  
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      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (ISB-CGC) Acute erythroleukemia (FAB type M6)  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (ISB-CGC) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (ISB-CGC) Acute megakaryoblastic leukemia (FAB type M7)  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (ISB-CGC) Acute monoblastic leukemia without differentiation (FAB type M5a)  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloblastic leukemia with minimal differentiation (FAB type M0)  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloblastic leukemia without maturation (FAB type M1)  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloid leukemia, NOS  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myelomonocytic leukemia (FAB type M4)  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (ISB-CGC) Acute undifferentiated leukemia  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (ISB-CGC) Chronic lymphocytic leukemia  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (ISB-CGC) Chronic myeloid leukemia, t(9;22)  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (ISB-CGC) Chronic myelomonocytic leukemia  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (ISB-CGC) Chronic myeloproliferative disorder, NOS  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (ISB-CGC) Diffuse large B-cell lymphoma  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (ISB-CGC) Essential thrombocythemia  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (ISB-CGC) Idiopathic myelofibrosis  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (ISB-CGC) Multiple myeloma  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (ISB-CGC) Myelodysplastic/myeloproliferative disease, NOS  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (ISB-CGC) Myelodysplastic syndrome, NOS  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (ISB-CGC) Polycythemia vera  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (ISB-CGC) Refractory anemia  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (ISB-CGC) Refractory anemia with excess blasts-1  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (ISB-CGC) Refractory anemia with excess blasts-2  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (ISB-CGC) Refractory anemia with excess of blasts (FAB)  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (ISB-CGC) Refractory anemia with ringed sideroblasts  
      Mitelmandel(20)(q12)  Mitelman (ISB-CGC) Refractory cytopenia with multilineage dysplasia  
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      Mitelmandel(20)(q12q13)  Mitelman (ISB-CGC) Acute myeloid leukemia, NOS  
      Mitelmandel(20)(q12q13)  Mitelman (ISB-CGC) Refractory anemia  
      Mitelmandel(20)(q12q13)  Mitelman (ISB-CGC) Refractory anemia with excess of blasts (FAB)  
      Mitelmandel(20)(q12q13)  Mitelman (ISB-CGC) Refractory anemia with ringed sideroblasts  
    11p1520q12dbCRIDder(11)t(11;20)(p15;q12)NUP98/TOP1 11581T-Cell Myelodysplastic Syndrome[PubMed] 
      Mitelmander(7)t(7;20)(q31;q12)  Mitelman (ISB-CGC) Multiple myeloma  
      Mitelmandic(8;20)(p11;q12)  Mitelman (ISB-CGC) Myelodysplastic syndrome, NOS  
    20p1120q12Cosmic_SVdup(20)(p11q12)  Cosmic_SV [COST164384]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
    20q1120q12Cosmic_SVdup(20)(q11q12)  Cosmic_SV [COST141196]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
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    20q1220q12Cosmic_SVinv(20)(q12q12)  Cosmic_SV [COST193493]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU328]
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    Genes in band 20q12

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    [Mitelman]    		 Acute monoblastic leukemia with differentiation (FAB type M5b) [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028822-41124486 + 20q12 11p15 Gene [M]   NUP98/TOP1 TOP1 NUP98 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2) [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    [Mitelman]    		 Acute myeloblastic leukemia without maturation (FAB type M1) [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028822-41124486 + 20q12 11p15 Gene [M]   NUP98/TOP1 TOP1 NUP98 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Acute myeloid leukemia, NOS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028822-41124486 + 20q12 11p15 Gene [M]   NUP98/TOP1 TOP1 NUP98 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Acute myelomonocytic leukemia (FAB type M4) [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028822-41124486 + 20q12 11p15 Gene [M]   NUP98/TOP1 TOP1 NUP98 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Refractory anemia with excess of blasts (FAB) [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028822-41124486 + 20q12 12p13 Gene [M]   TOP1/PZP TOP1 PZP [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    [Mitelman]    		 Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028822-41124486 + 20q12 19q13 Gene [M]   ZNF813/TOP1 TOP1 ZNF813 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr20:41028822-41124486 + 20q12 11p15 Gene [PM]   NUP98/TOP1 TOP1 NUP98 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028822-41124486 + 20q12 11p15 Gene [PM]   NUP98/TOP1 TOP1 NUP98 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028822-41124486 + 20q12 11p15 Gene [S]   NUP98/TOP1 TOP1 NUP98 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr20:41028822-41124486 + 20q12 20q13 Gene [TF]   TOP1/CDH4 TOP1 CDH4 [Cosmic]
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    chr20:41028822-41124486 + 20q12 12p13 Gene [TF]   TOP1/PZP TOP1 PZP [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41028822-41124486 + 20q12 11p15 Gene [TIC]   NUP98/TOP1 TOP1 NUP98 [Cosmic]
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    chr20:41137543-41177626 + 20q12 19q13 Gene [GDB]   MYH14/PLCG1 PLCG1 MYH14 [Cosmic]
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    chr20:41137543-41177626 + 20q12 20q13 Gene [GDB]   PLCG1/TAF4 PLCG1 TAF4 [Cosmic]
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    chr20:41137543-41177626 + 20q12 6p21 Gene [GDB]   ZBTB22/PLCG1 PLCG1 ZBTB22 [Cosmic]
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    chr20:41137543-41177626 + 20q12 2q22 Gene [GDB]   ZEB2/PLCG1 PLCG1 ZEB2 [Cosmic]
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    chr20:41137543-41177626 + 20q12 4q12 Gene [H3]   PLCG1/KDR PLCG1 KDR [Cosmic] angiosarcoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41137543-41177626 + 20q12 4q12 Gene [H4]   PLCG1/KDR PLCG1 KDR [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr20:41137543-41177626 + 20q12 20q11 Gene [M]   PLCG1/BPIFB1 PLCG1 BPIFB1 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41137543-41177626 + 20q12 20q13 Gene [M]   PLCG1/EYA2 PLCG1 EYA2 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Stomach Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41137543-41177626 + 20q12 20q13 Gene [M]   PLCG1/TAF4 PLCG1 TAF4 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41137543-41177626 + 20q12 20q11 Gene [M]   TRPC4AP/PLCG1 PLCG1 TRPC4AP [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41137543-41177626 + 20q12   Gene [A]     PLCG1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr20:41137543-41177626 + 20q12   Gene [PM]   / PLCG1   [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41137543-41177626 + 20q12 16q22 Gene [PM]   PLCG1/TAT PLCG1 TAT [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41137543-41177626 + 20q12 20q11 Gene [TF]   PLCG1/BPIFB1 PLCG1 BPIFB1 [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41137543-41177626 + 20q12 20q13 Gene [TF]   PLCG1/TAF4 PLCG1 TAF4 [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41169023-41169078 + 20q12   Gene [G]     MIR6871       [Omim] [Entrez]
    chr20:41178455-41300120 - 20q12 20q12 Gene [AM]   ZHX3/PLCG1-AS1 ZHX3 PLCG1-AS1 [Cosmic]
    		     [Omim] [Entrez]
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    chr20:41178455-41300120 - 20q12 2p16 Gene [CT]   ZHX3/SPTBN1 ZHX3 SPTBN1 [Cosmic]
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    chr20:41178455-41300120 - 20q12 1p36 Gene [CT]   ZHX3/SRM ZHX3 SRM [Cosmic]
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    chr20:41178455-41300120 - 20q12   Gene [G]     ZHX3   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr20:41178455-41300120 - 20q12 20q12 Gene [GDB]   ZHX3/CHD6 ZHX3 CHD6 [Cosmic]
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    chr20:41178455-41300120 - 20q12 20q13 Gene [GDB]   CTSZ/ZHX3 ZHX3 CTSZ [Cosmic]
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    chr20:41178455-41300120 - 20q12 19p13 Gene [GDB]   ZHX3/PDE4C ZHX3 PDE4C [Cosmic]
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    chr20:41178455-41300120 - 20q12 19q13 Gene [GDB]   ZHX3/SMG9 ZHX3 SMG9 [Cosmic]
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    chr20:41178455-41300120 - 20q12 2p16 Gene [GDB]   ZHX3/SPTBN1 ZHX3 SPTBN1 [Cosmic]
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    chr20:41178455-41300120 - 20q12 20q11 Gene [GDB]   ZHX3/VSTM2L ZHX3 VSTM2L [Cosmic]
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    chr20:41178455-41300120 - 20q12 20q13 Gene [M]   CTSZ/ZHX3 ZHX3 CTSZ [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41178455-41300120 - 20q12 19p13 Gene [M]   ZHX3/PDE4C ZHX3 PDE4C [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Brain Astrocytoma, grade III-IV/Glioblastoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41178455-41300120 - 20q12 19q13 Gene [M]   ZHX3/SMG9 ZHX3 SMG9 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Lung Mesothelioma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41178455-41300120 - 20q12 19q13 Gene [M]   ZHX3/SMG9 ZHX3 SMG9 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Pleura Mesothelioma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41178455-41300120 - 20q12 20q11 Gene [M]   ZHX3/VSTM2L ZHX3 VSTM2L [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Stomach Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41340821-41360582 + 20q12   Gene [G]     LPIN3   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr20:41340821-41360582 + 20q12 6q24 Gene [GDB]   SASH1/LPIN3 LPIN3 SASH1 [Cosmic]
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    chr20:41340821-41360582 + 20q12 20q12 Gene [GDB]   TOP1/LPIN3 LPIN3 TOP1 [Cosmic]
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    chr20:41340821-41360582 + 20q12 6q24 Gene [M]   SASH1/LPIN3 LPIN3 SASH1 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41359963-41366818 - 20q12   Gene [G]     EMILIN3   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr20:41359963-41366818 - 20q12 20q13 Gene [M]   PMEPA1/EMILIN3 EMILIN3 PMEPA1 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41359963-41366818 - 20q12 20q13 Gene [TF]   PMEPA1/EMILIN3 EMILIN3 PMEPA1 [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12   Gene [K]   / CHD6   [Cosmic] Mental Retardation Syndrome [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12   Gene [A]     CHD6   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12 20q12 Gene [CT]   CHD6/CHD6 CHD6 CHD6 [Cosmic]
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    chr20:41402083-41618377 - 20q12 20q12 Gene [CT]   CHD6/CHD6 CHD6 CHD6 [Cosmic]
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    chr20:41402083-41618377 - 20q12 15q23 Gene [CT]   CHD6/PKM CHD6 PKM [Cosmic]
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    chr20:41402083-41618377 - 20q12 15q23 Gene [CT]   PKM/CHD6 CHD6 PKM [Cosmic]
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    chr20:41402083-41618377 - 20q12 22q12 Gene [CT]   CHD6/TFIP11 CHD6 TFIP11 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12   Gene [FM]   CHD6/RP11-80K6.2 CHD6 RP11-80K6.2 [Cosmic] breast HER2 [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12 20p11 Gene [GDB]   CHD6/ABHD12 CHD6 ABHD12 [Cosmic]
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    chr20:41402083-41618377 - 20q12 20q13 Gene [GDB]   CHD6/ATP9A CHD6 ATP9A [Cosmic]
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    chr20:41402083-41618377 - 20q12 20q12 Gene [GDB]   CHD6/CHD6 CHD6 CHD6 [Cosmic]
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    chr20:41402083-41618377 - 20q12 15q25 Gene [GDB]   CHD6/CHRNB4 CHD6 CHRNB4 [Cosmic]
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    chr20:41402083-41618377 - 20q12 20q11 Gene [GDB]   CHD6/CNBD2 CHD6 CNBD2 [Cosmic]
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    chr20:41402083-41618377 - 20q12 20q11 Gene [GDB]   CHD6/CTNNBL1 CHD6 CTNNBL1 [Cosmic]
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    chr20:41402083-41618377 - 20q12 17q21 Gene [GDB]   CHD6/DHX58 CHD6 DHX58 [Cosmic]
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    chr20:41402083-41618377 - 20q12 2p11 Gene [GDB]   DNAH6/CHD6 CHD6 DNAH6 [Cosmic]
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    chr20:41402083-41618377 - 20q12 14q32 Gene [GDB]   CHD6/EFCAB11 CHD6 EFCAB11 [Cosmic]
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    chr20:41402083-41618377 - 20q12 11q14 Gene [GDB]   CHD6/FAT3 CHD6 FAT3 [Cosmic]
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    chr20:41402083-41618377 - 20q12 11q13 Gene [GDB]   LRP5/CHD6 CHD6 LRP5 [Cosmic]
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    chr20:41402083-41618377 - 20q12 11q21 Gene [GDB]   CHD6/MAML2 CHD6 MAML2 [Cosmic]
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    chr20:41402083-41618377 - 20q12 6p23 Gene [GDB]   CHD6/MCUR1 CHD6 MCUR1 [Cosmic]
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    chr20:41402083-41618377 - 20q12 20q11 Gene [GDB]   CHD6/MYH7B CHD6 MYH7B [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12 20q13 Gene [GDB]   CHD6/NCOA5 CHD6 NCOA5 [Cosmic]
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    chr20:41402083-41618377 - 20q12 Xp22 Gene [GDB]   CHD6/P2RY8 CHD6 P2RY8 [Cosmic]
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    chr20:41402083-41618377 - 20q12 20q13 Gene [GDB]   PCMTD2/CHD6 CHD6 PCMTD2 [Cosmic]
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    chr20:41402083-41618377 - 20q12 15q23 Gene [GDB]   CHD6/PKM CHD6 PKM [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12 15q23 Gene [GDB]   PKM/CHD6 CHD6 PKM [Cosmic]
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    chr20:41402083-41618377 - 20q12 20q12 Gene [GDB]   CHD6/PTPRT CHD6 PTPRT [Cosmic]
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    chr20:41402083-41618377 - 20q12 20q13 Gene [GDB]   CHD6/SNX21 CHD6 SNX21 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12 1p36 Gene [GDB]   CHD6/SPEN CHD6 SPEN [Cosmic]
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    chr20:41402083-41618377 - 20q12 20p13 Gene [GDB]   STK35/CHD6 CHD6 STK35 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12 17q23 Gene [GDB]   TANC2/CHD6 CHD6 TANC2 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12 22q12 Gene [GDB]   CHD6/TFIP11 CHD6 TFIP11 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12 20q13 Gene [GDB]   CHD6/TSHZ2 CHD6 TSHZ2 [Cosmic]
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    chr20:41402083-41618377 - 20q12 20q13 Gene [GDB]   CHD6/WFDC11 CHD6 WFDC11 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12 20q12 Gene [GDB]   ZHX3/CHD6 CHD6 ZHX3 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12 19q13 Gene [GDB]   CHD6/ZNF235 CHD6 ZNF235 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12 10q25 Gene [H2]   TCF7L2/CHD6 CHD6 TCF7L2 [Cosmic] mentalretardationbut with outtheclassicalPitt-Hopkins syndrome [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12 6q13 Gene [H3]   LMBRD1/CHD6 CHD6 LMBRD1 [Cosmic] acute myeloid leukemia;myeloid leukemia;leukemia [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12 6q13 Gene [H4]   LMBRD1/CHD6 CHD6 LMBRD1 [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12 20p11 Gene [M]   CHD6/ABHD12 CHD6 ABHD12 [Cosmic]
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    [Mitelman]    		 Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12 20q13 Gene [M]   PCMTD2/CHD6 CHD6 PCMTD2 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12 20q13 Gene [M]   CHD6/SNX21 CHD6 SNX21 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12 1p36 Gene [M]   CHD6/SPEN CHD6 SPEN [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Miscellaneous hematopoietic/lymphoid neoplasm, special type [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12 1p36 Gene [M]   CHD6/SPEN CHD6 SPEN [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Thyroid Benign epithelial tumor, special type [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12 17q23 Gene [M]   TANC2/CHD6 CHD6 TANC2 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12 20q13 Gene [M]   CHD6/TSHZ2 CHD6 TSHZ2 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12 20q13 Gene [M]   CHD6/TSHZ2 CHD6 TSHZ2 [Cosmic]
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    chr20:41402083-41618377 - 20q12 20q13 Gene [M]   CHD6/WFDC11 CHD6 WFDC11 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12 19q13 Gene [M]   CHD6/ZNF235 CHD6 ZNF235 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12   Gene [PC]   CHD6/INMT-FAM188B CHD6 INMT-FAM188B [Cosmic] [Ovary-AdenoCA] OV-AU [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12 20p11 Gene [TF]   CHD6/ABHD12 CHD6 ABHD12 [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12 20q11 Gene [TF]   CHD6/CNBD2 CHD6 CNBD2 [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12 14q32 Gene [TF]   CHD6/EFCAB11 CHD6 EFCAB11 [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12 11q14 Gene [TF]   CHD6/FAT3 CHD6 FAT3 [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12 11q13 Gene [TF]   LRP5/CHD6 CHD6 LRP5 [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12 6p23 Gene [TF]   CHD6/MCUR1 CHD6 MCUR1 [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12 20p13 Gene [TF]   STK35/CHD6 CHD6 STK35 [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12 17q23 Gene [TF]   TANC2/CHD6 CHD6 TANC2 [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:41402083-41618377 - 20q12 20q13 Gene [TF]   CHD6/WFDC11 CHD6 WFDC11 [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:42072756-43189906 - 20q12   Gene [CEN]     PTPRT   [Cosmic]
    [Census]    		     [Omim] [Entrez]
    chr20:42072756-43189906 - 20q12 20q12 Gene [CT]   PTPRT/PTPRT PTPRT PTPRT [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr20:42072756-43189906 - 20q12 20q12 Gene [CT]   PTPRT/PTPRT PTPRT PTPRT [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr20:42072756-43189906 - 20q12 12q24 Gene [CT]   PTPRT/ZCCHC8 PTPRT ZCCHC8 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr20:42072756-43189906 - 20q12   Gene [G]     PTPRT   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr20:42072756-43189906 - 20q12 20q12 Gene [GDB]   CHD6/PTPRT PTPRT CHD6 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:42072756-43189906 - 20q12 4q12 Gene [GDB]   DCUN1D4/PTPRT PTPRT DCUN1D4 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:42072756-43189906 - 20q12 14q24 Gene [GDB]   PTPRT/EXD2 PTPRT EXD2 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:42072756-43189906 - 20q12 11q14 Gene [GDB]   GAB2/PTPRT PTPRT GAB2 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:42072756-43189906 - 20q12 11q14 Gene [GDB]   INTS4/PTPRT PTPRT INTS4 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:42072756-43189906 - 20q12 20q13 Gene [GDB]   NCOA3/PTPRT PTPRT NCOA3 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:42072756-43189906 - 20q12 20q13 Gene [GDB]   PTPRT/NCOA3 PTPRT NCOA3 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:42072756-43189906 - 20q12 8q21 Gene [GDB]   PTPRT/OSGIN2 PTPRT OSGIN2 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:42072756-43189906 - 20q12 20q11 Gene [GDB]   PIGU/PTPRT PTPRT PIGU [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:42072756-43189906 - 20q12 20q12 Gene [GDB]   PTPRT/PTPRT PTPRT PTPRT [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:42072756-43189906 - 20q12 20q11 Gene [GDB]   SRC/PTPRT PTPRT SRC [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:42072756-43189906 - 20q12 20q12 Gene [GDB]   TOP1/PTPRT PTPRT TOP1 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:42072756-43189906 - 20q12 12q24 Gene [GDB]   PTPRT/ZCCHC8 PTPRT ZCCHC8 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:42072756-43189906 - 20q12 20q13 Gene [GDB]   ZSWIM3/PTPRT PTPRT ZSWIM3 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr20:42072756-43189906 - 20q12 14q24 Gene [M]   PTPRT/EXD2 PTPRT EXD2 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:42072756-43189906 - 20q12 11q14 Gene [M]   GAB2/PTPRT PTPRT GAB2 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Skin Malignant melanoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:42072756-43189906 - 20q12 11q14 Gene [M]   INTS4/PTPRT PTPRT INTS4 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:42072756-43189906 - 20q12 20q13 Gene [M]   NCOA3/PTPRT PTPRT NCOA3 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Unknown site Mesenchymal tumor, NOS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:42072756-43189906 - 20q12 20q13 Gene [M]   PTPRT/NCOA3 PTPRT NCOA3 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:42072756-43189906 - 20q12 8q21 Gene [M]   PTPRT/OSGIN2 PTPRT OSGIN2 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Brain Astrocytoma, grade I-II [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:42072756-43189906 - 20q12 20q11 Gene [M]   PIGU/PTPRT PTPRT PIGU [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:42072756-43189906 - 20q12 20q13 Gene [M]   PRELID3B/PTPRT PTPRT PRELID3B [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:42072756-43189906 - 20q12 20q11 Gene [M]   SRC/PTPRT PTPRT SRC [Cosmic]
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    chr20:42072756-43189906 - 20q12 20q11 Gene [PM]   RALY/PTPRT PTPRT RALY [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:42072756-43189906 - 20q12 4q21 Gene [PM]   WDFY3/PTPRT PTPRT WDFY3 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:42072756-43189906 - 20q12 14q24 Gene [TF]   PTPRT/EXD2 PTPRT EXD2 [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-LUAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:42072756-43189906 - 20q12 20q13 Gene [TF]   PTPRT/NCOA3 PTPRT NCOA3 [Cosmic]
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    chr20:42072756-43189906 - 20q12 20q11 Gene [TF]   PIGU/PTPRT PTPRT PIGU [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr20:42685483-42688562 + 20q12   Gene [G]     LOC101927159       [Omim] [Entrez]

    [ Bold normal : A; Italic normal :G; Italic small : E ]

    X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22
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    Mitelman Database [NCI] : Breakpoint 20q12

    [ UCSC ][ enSembl ][ MapView - NCBI ][ 1000Genomes ][ EVS ][ CGWB ][ DGV ][ DBVar ][ OMIM ][ HapMap ][ DECIPHER ] [ ECARUCA ]
    Gene Expression (MSigDB) in 20q12  [ HTC ]  [ NCI ]  [ INV ]

    Global tables

  • Anomalies list (tabulated txt file)
  • Genes list (tabulated txt file)
  • Anomalies list - limited to abnormalities with gene fusions(tabulated txt file)
  • Genes list - limited to genes fusions (tabulated txt file)
  • list of gene fusions for each gene (with origins of the data)
  • list of gene fusions by origin (with topography and morphology)

    References

    Contributor(s)

    Writtenmay 2012Philippe Dessen
      
    Updatedjuin 2020Philippe Dessen and Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P and Huret JL. Chromosomal band 20q12. Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. July 2012.
    URL : http://atlasgeneticsoncology.org/Bands/20q12.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : lun. juin 1 14:56:15 CEST 2020

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