Chromosome 6

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology

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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 6


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Band 6q12

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  • Chromosomal abnormalities in band 6q12
  • Genes in band 6q12 (reference hg38)
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    Chromosomal abnormalities in band 6q12

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    Genes in band 6q12

    (click on headers to reorder columns)
    GoldenPath hg38Band 1Band 2ClassCloneFusionPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphologyPubmedOmimAccession
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    chr6:63572012-63583588 + 6q12   Gene [G]     PTP4A1   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
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    chr6:63572012-63583588 + 6q12 6q12 Gene [GDB]   PTP4A1/PTP4A1 PTP4A1 PTP4A1 [Cosmic]
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    chr6:63572012-63583588 + 6q12 20q13 Gene [M]   ARFGEF2/PTP4A1 PTP4A1 ARFGEF2 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Lung Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:63572012-63583588 + 6q12 17q11 Gene [M]   ATAD5/PTP4A1 PTP4A1 ATAD5 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Bladder Transitional cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:63572012-63583588 + 6q12 6p21 Gene [M]   CDKN1A/PTP4A1 PTP4A1 CDKN1A [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Multiple myeloma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:63572012-63583588 + 6q12 19p13 Gene [M]   PTP4A1/NOTCH3 PTP4A1 NOTCH3 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Oesophagus Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:63572012-63583588 + 6q12 1q32 Gene [M]   SMYD2/PTP4A1 PTP4A1 SMYD2 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Bladder Transitional cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:63572012-63583588 + 6q12 17q11 Gene [TF]   ATAD5/PTP4A1 PTP4A1 ATAD5 [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-BLCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:63572012-63583588 + 6q12 6q12 Gene [TF]   PTP4A1/EYS PTP4A1 EYS [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    		 [TCGA-PRAD]     [Omim] [Entrez]
    chr6:63646526-63726011 + 6q12 16p13 Gene [CT]   PHF3/NOMO2 PHF3 NOMO2 [Cosmic]
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    chr6:63646526-63726011 + 6q12 6q12 Gene [CT]   PHF3/PHF3 PHF3 PHF3 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:63646526-63726011 + 6q12 6q12 Gene [CT]   PHF3/PHF3 PHF3 PHF3 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:63646526-63726011 + 6q12 6q12 Gene [CT]   PHF3/PHF3 PHF3 PHF3 [Cosmic]
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    chr6:63646526-63726011 + 6q12 22q12 Gene [CT]   SEZ6L/PHF3 PHF3 SEZ6L [Cosmic]
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    chr6:63646526-63726011 + 6q12   Gene [G]     PHF3   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
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    chr6:63646526-63726011 + 6q12 8p11 Gene [GDB]   PHF3/FNTA PHF3 FNTA [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:63646526-63726011 + 6q12 16p13 Gene [GDB]   PHF3/NOMO2 PHF3 NOMO2 [Cosmic]
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    chr6:63646526-63726011 + 6q12 6q22 Gene [GDB]   PHF3/NUS1 PHF3 NUS1 [Cosmic]
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    chr6:63646526-63726011 + 6q12 6q12 Gene [GDB]   PHF3/PHF3 PHF3 PHF3 [Cosmic]
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    chr6:63646526-63726011 + 6q12 6q26 Gene [GDB]   PHF3/QKI PHF3 QKI [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:63646526-63726011 + 6q12 8p21 Gene [GDB]   PHF3/R3HCC1 PHF3 R3HCC1 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:63646526-63726011 + 6q12 13q12 Gene [GDB]   SACS/PHF3 PHF3 SACS [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:63646526-63726011 + 6q12 22q12 Gene [GDB]   SEZ6L/PHF3 PHF3 SEZ6L [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:63646526-63726011 + 6q12 18q12 Gene [GDB]   PHF3/SYT4 PHF3 SYT4 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:63646526-63726011 + 6q12 8q12 Gene [GDB]   UBXN2B/PHF3 PHF3 UBXN2B [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:63646526-63726011 + 6q12 10p15 Gene [M]   PHF3/AKR1C1 PHF3 AKR1C1 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:63646526-63726011 + 6q12 6q23 Gene [M]   PHF3/ENPP3 PHF3 ENPP3 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Uterus, corpus Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:63646526-63726011 + 6q12 8p11 Gene [M]   PHF3/FNTA PHF3 FNTA [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:63646526-63726011 + 6q12 6q22 Gene [M]   PHF3/NUS1 PHF3 NUS1 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:63646526-63726011 + 6q12 8p21 Gene [M]   PHF3/R3HCC1 PHF3 R3HCC1 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:63646526-63726011 + 6q12 13q12 Gene [M]   SACS/PHF3 PHF3 SACS [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Nasopharynx Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:63646526-63726011 + 6q12 13q12 Gene [M]   SACS/PHF3 PHF3 SACS [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Oral cavity Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:63646526-63726011 + 6q12 18q12 Gene [M]   PHF3/SYT4 PHF3 SYT4 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Unknown site Mesenchymal tumor, NOS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:63646526-63726011 + 6q12 8q12 Gene [M]   UBXN2B/PHF3 PHF3 UBXN2B [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Unknown site Mesenchymal tumor, NOS [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:63646526-63726011 + 6q12 6q12 Gene [PM]   PHF3/EYS PHF3 EYS [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:63646526-63726011 + 6q12 6q12 Gene [TF]   PHF3/EYS PHF3 EYS [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-BRCA]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:63646526-63726011 + 6q12 8p21 Gene [TF]   PHF3/R3HCC1 PHF3 R3HCC1 [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-PRAD]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:63646526-63726011 + 6q12 13q12 Gene [TF]   SACS/PHF3 PHF3 SACS [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-HNSC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:65301418-65305611 + 6q12   Gene [G]     LOC441155       [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 4q21 Gene [CT]   EYS/SCARB2 EYS SCARB2 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6q21 Gene [FM]   ATG5/EYS EYS ATG5 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6p24 Gene [GAO]   RIOK1/EYS EYS RIOK1 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12   Gene [G]     EYS   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6q12 Gene [GDB]   EYS/ADGRB3 EYS ADGRB3 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 9q34 Gene [GDB]   ANAPC2/EYS EYS ANAPC2 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 3p25 Gene [GDB]   ANKRD28/EYS EYS ANKRD28 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6p12 Gene [GDB]   DST/EYS EYS DST [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6p24 Gene [GDB]   EEF1E1/EYS EYS EEF1E1 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 10q23 Gene [GDB]   EXOC6/EYS EYS EXOC6 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 1q42 Gene [GDB]   GALNT2/EYS EYS GALNT2 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6p24 Gene [GDB]   GFOD1/EYS EYS GFOD1 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 19q13 Gene [GDB]   GPI/EYS EYS GPI [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6q16 Gene [GDB]   GRIK2/EYS EYS GRIK2 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 2p25 Gene [GDB]   KIDINS220/EYS EYS KIDINS220 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6q13 Gene [GDB]   LMBRD1/EYS EYS LMBRD1 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6p25 Gene [GDB]   LYRM4/EYS EYS LYRM4 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 17q12 Gene [GDB]   MED1/EYS EYS MED1 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 11q13 Gene [GDB]   PAK1/EYS EYS PAK1 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 21q22 Gene [GDB]   PDXK/EYS EYS PDXK [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6q12 Gene [GDB]   PHF3/EYS EYS PHF3 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6q12 Gene [GDB]   PTP4A1/EYS EYS PTP4A1 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6q22 Gene [GDB]   PTPRK/EYS EYS PTPRK [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6p24 Gene [GDB]   RIOK1/EYS EYS RIOK1 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 4q21 Gene [GDB]   EYS/SCARB2 EYS SCARB2 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6q21 Gene [GDB]   SESN1/EYS EYS SESN1 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 3p26 Gene [GDB]   SETMAR/EYS EYS SETMAR [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 4q31 Gene [GDB]   SLC10A7/EYS EYS SLC10A7 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6q14 Gene [GDB]   SNX14/EYS EYS SNX14 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6q24 Gene [GDB]   EYS/STX11 EYS STX11 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 20q11 Gene [GDB]   TPX2/EYS EYS TPX2 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6p21 Gene [GDB]   XPO5/EYS EYS XPO5 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6q14 Gene [GDB]   ZNF292/EYS EYS ZNF292 [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 9q34 Gene [M]   ANAPC2/EYS EYS ANAPC2 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Bladder Transitional cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 3p25 Gene [M]   ANKRD28/EYS EYS ANKRD28 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 19p13 Gene [M]   EYS/CAMSAP3 EYS CAMSAP3 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Brain Astrocytoma, grade I-II [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6q22 Gene [M]   CEP85L/EYS EYS CEP85L [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Brain Astrocytoma, grade I-II [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6p22 Gene [M]   EYS/DEK EYS DEK [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6p12 Gene [M]   DST/EYS EYS DST [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Brain Astrocytoma, grade III-IV/Glioblastoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6p12 Gene [M]   DST/EYS EYS DST [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Liver Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6p24 Gene [M]   EEF1E1/EYS EYS EEF1E1 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 10q23 Gene [M]   EXOC6/EYS EYS EXOC6 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Thyroid Benign epithelial tumor, special type [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 1q42 Gene [M]   GALNT2/EYS EYS GALNT2 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 19q13 Gene [M]   GPI/EYS EYS GPI [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Nasopharynx Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6q16 Gene [M]   GRIK2/EYS EYS GRIK2 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Brain Astrocytoma, grade I-II [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 2p25 Gene [M]   KIDINS220/EYS EYS KIDINS220 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Bladder Transitional cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6p25 Gene [M]   LYRM4/EYS EYS LYRM4 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Liver Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 21q22 Gene [M]   PDXK/EYS EYS PDXK [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6q22 Gene [M]   PTPRK/EYS EYS PTPRK [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Uterus, corpus Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6p24 Gene [M]   RIOK1/EYS EYS RIOK1 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Uterus, cervix Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 3p26 Gene [M]   SETMAR/EYS EYS SETMAR [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 4q31 Gene [M]   SLC10A7/EYS EYS SLC10A7 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6q14 Gene [M]   SNX14/EYS EYS SNX14 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Breast Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 11p15 Gene [M]   SOX6/EYS EYS SOX6 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Uterus, cervix Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6q24 Gene [M]   EYS/STX11 EYS STX11 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Brain Astrocytoma, grade I-II [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 20q11 Gene [M]   TPX2/EYS EYS TPX2 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Lung Squamous cell carcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6p21 Gene [M]   XPO5/EYS EYS XPO5 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Liver Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6q14 Gene [M]   ZNF292/EYS EYS ZNF292 [Cosmic]
    [Mitelman]    		 Prostate Adenocarcinoma [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6q14 Gene [PC]   EYS/FILIP1 EYS FILIP1 [Cosmic] [Liver-HCC] LIRI-JP [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6q13 Gene [PC]   LMBRD1/EYS EYS LMBRD1 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6q12 Gene [PM]   PHF3/EYS EYS PHF3 [Cosmic]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:65334913-65579804 - 6q12 6p12 Gene [TF]   DST/EYS EYS DST [Cosmic]
    [TCGA]    		 [TCGA-GBM]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
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    [TCGA]    		 [TCGA-LUSC]   [PubMed] [Omim] [Entrez]
    chr6:65787879-65789483 + 6q12   Gene [G]     SLC25A51P1       [Omim] [Entrez]
    chr6:68055351-68060502 + 6q12   Gene [G]     LOC102723883       [Omim] [Entrez]
    chr6:68226970-68329899 - 6q12   Gene [G]     LINC02549       [Omim] [Entrez]
    chr6:68632663-68634324 - 6q12   Gene [G]     LOC101928307       [Omim] [Entrez]
    chr6:68635282-69389506 + 6q12 17p13 Gene [CT]   ADGRB3/ALOXE3 ADGRB3 ALOXE3 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:68635282-69389506 + 6q12 17p13 Gene [CT]   ADGRB3/ALOXE3 ADGRB3 ALOXE3 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:68635282-69389506 + 6q12 1q21 Gene [CT]   ADGRB3/C1orf56 ADGRB3 C1orf56 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:68635282-69389506 + 6q12 7p14 Gene [CT]   ADGRB3/MTURN ADGRB3 MTURN [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:68635282-69389506 + 6q12 15q22 Gene [CT]   RORA/ADGRB3 ADGRB3 RORA [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:68635282-69389506 + 6q12 3q25 Gene [CT]   TM4SF1/ADGRB3 ADGRB3 TM4SF1 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:68635282-69389506 + 6q12 3q26 Gene [CT]   ADGRB3/TNIK ADGRB3 TNIK [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:68635282-69389506 + 6q12 15q11 Gene [CT]   ADGRB3/TUBGCP5 ADGRB3 TUBGCP5 [Cosmic]
    [ChiTaRS]      		     [Omim] [GenBank]
    chr6:68635282-69389506 + 6q12   Gene [G]     ADGRB3   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]
    chr6:68635282-69389506 + 6q12 6q12 Gene [GDB]   EYS/ADGRB3 ADGRB3 EYS [Cosmic]
    [FusionGDB]      		     [Omim]