Chromosome 9

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


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X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22

Chromosome 9


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Band 9q13

chr9:61500000-65000000 (3500 Kb)

  • Chromosomal abnormalities in band 9q13
  • Genes in band 9q13 (reference hg38)
  • External links
  • References

    Chromosomal abnormalities in band 9q13

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    Band 1Band 2ClassEntityPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphology[PubMed][Study]
      Mitelmandel(9)(q11q13)  Mitelman (CGAP) Chronic lymphocytic leukemia  
    9q13 Cosmic_SVdel(9)(q13)  Cosmic_SV [COST118993]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU328]
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    9q13 Cosmic_SVdel(9)(q13)  Cosmic_SV [COST141992]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
    9q139q13dbCRIDdel(9)(q13.1q13.4) 10760Mesenchymal Hamartoma of Liver[PubMed] 
    9q13 Cosmic_SVdel(9)(q13)  Cosmic_SV [COST222498]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU382]
    9q13 Cosmic_SVdel(9)(q13)  Cosmic_SV [COST450810]pancreas__NScarcinoma__NS [COSU382]
    9q13 Cosmic_SVdel(9)(q13)  Cosmic_SV [COST500207]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU382]
      Mitelmandel(9)(q13)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmandel(9)(q13)  Mitelman (CGAP) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
      Mitelmandel(9)(q13)  Mitelman (CGAP) Acute myeloid leukemia, NOS  
      Mitelmandel(9)(q13)  Mitelman (CGAP) Acute myelomonocytic leukemia (FAB type M4)  
      Mitelmandel(9)(q13)  Mitelman (CGAP) Anaplastic large cell lymphoma, systemic type  
      Mitelmandel(9)(q13)  Mitelman (CGAP)BreastAdenocarcinoma  
      Mitelmandel(9)(q13)  Mitelman (CGAP) Diffuse large B-cell lymphoma  
      Mitelmandel(9)(q13)  Mitelman (CGAP) Mantle cell lymphoma  
    9q139q21Cosmic_SVdel(9)(q13q21)  Cosmic_SV [COST154189]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
    9q139q21Cosmic_SVdel(9)(q13q21)  Cosmic_SV [COST184000]skin__NScarcinoma__NS [COSU656]
    9q139q21Cosmic_SVdel(9)(q13q21)  Cosmic_SV [COST184916]skin__NScarcinoma__NS [COSU656]
    9q139q22Cosmic_SVdel(9)(q13q22)  Cosmic_SV [COST159068]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
      Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Acute monoblastic leukemia (FAB type M5)  
      Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
      Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Acute myeloblastic leukemia without maturation (FAB type M1)  
      Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Acute myeloid leukemia, NOS  
      Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Acute myelomonocytic leukemia (FAB type M4)  
      Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Acute promyelocytic leukemia (FAB type M3)  
      Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Adult T-cell lymphoma/leukemia (HTLV-1+)  
      Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Bilineage or biphenotypic leukemia  
      Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Mature B-cell neoplasm, NOS  
      Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Multiple myeloma  
      Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Mycosis fungoides/Sézary syndrome  
      Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Myelodysplastic syndrome, NOS  
      Mitelmandel(9)(q13q22)  Mitelman (CGAP) Refractory anemia with excess of blasts (FAB)  
    9q139q31dbCRIDdel(9)(q13q31) 11160Myelodysplastic Syndrome[PubMed] 
      Mitelmandel(9)(q13q31)  Mitelman (CGAP) Acute erythroleukemia (FAB type M6)  
      Mitelmandel(9)(q13q31)  Mitelman (CGAP) Acute monoblastic leukemia (FAB type M5)  
      Mitelmandel(9)(q13q31)  Mitelman (CGAP) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
      Mitelmandel(9)(q13q31)  Mitelman (CGAP) Acute myeloid leukemia, NOS  
      Mitelmandel(9)(q13q31)  Mitelman (CGAP) Acute myelomonocytic leukemia (FAB type M4)  
      Mitelmandel(9)(q13q32)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmandel(9)(q13q32)  Mitelman (CGAP) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
      Mitelmandel(9)(q13q32)  Mitelman (CGAP) Acute myeloid leukemia, NOS  
      Mitelmandel(9)(q13q32)  Mitelman (CGAP) Diffuse large B-cell lymphoma  
      Mitelmandel(9)(q13q32)  Mitelman (CGAP) Follicular lymphoma  
      Mitelmandel(9)(q13q33)  Mitelman (CGAP) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
      Mitelmandel(9)(q13q33)  Mitelman (CGAP) Multiple myeloma  
      Mitelmandel(9)(q13q34)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmandel(9)(q13q34)  Mitelman (CGAP) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
      Mitelmander(12)t(9;12)(q13;q24)  Mitelman (CGAP) Diffuse large B-cell lymphoma  
      Mitelmander(17)t(9;17)(q13;p11)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmander(1)t(1;9)(p36;q13)  Mitelman (CGAP) Follicular lymphoma  
      Mitelmander(5)t(5;9)(q11;q13)  Mitelman (CGAP) Acute megakaryoblastic leukemia (FAB type M7)  
      Mitelmander(9)t(1;9)(q12;q13)  Mitelman (CGAP) Multiple myeloma  
    9q13 Cosmic_SVdup(9)(q13)  Cosmic_SV [COST442852]pancreas__NScarcinoma__NS [COSU382]
    9q139q13Cosmic_SVdup(9)(q13q13)  Cosmic_SV [COST126375]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU328]
    9q139q13Cosmic_SVdup(9)(q13q13)  Cosmic_SV [COST129503]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU328]
    9q139q22Cosmic_SVdup(9)(q13q22)  Cosmic_SV [COST134583]ovary__NScarcinoma__mixed_adenosquamous_carcinoma [COSU585]
    9p119q13dbCRIDinv(9)(p11q13) 10012Psoriasis[PubMed] 
    9p119q13dbCRIDinv(9)(p11q13) 10653Isolated Growth Hormone Deficiency[PubMed] 
      Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (CGAP) Acute myeloblastic leukemia with maturation (FAB type M2)  
      Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (CGAP) Acute myeloid leukemia, NOS  
      Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (CGAP) Acute myelomonocytic leukemia (FAB type M4)  
      Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (CGAP) Chronic lymphocytic leukemia  
      Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (CGAP) Chronic myelomonocytic leukemia  
      Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (CGAP)LungSquamous cell carcinoma  
      Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (CGAP) Mature B-cell neoplasm, NOS  
      Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (CGAP) Multiple myeloma  
      Mitelmaninv(9)(p11q13)  Mitelman (CGAP) Nonneoplastic hematologic disorder/lesion  
      Mitelmaninv(9)(p12q13)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
      Mitelmaninv(9)(p12q13)  Mitelman (CGAP) Acute myeloid leukemia, NOS  
      Mitelmaninv(9)(p12q13)  Mitelman (CGAP) Bilineage or biphenotypic leukemia  
      Mitelmaninv(9)(p12q13)  Mitelman (CGAP)BreastAdenocarcinoma  
      Mitelmaninv(9)(p12q13)  Mitelman (CGAP) Chronic lymphocytic leukemia  
      Mitelmaninv(9)(p12q13)  Mitelman (CGAP) Myelodysplastic syndrome, NOS  
    9p139p13Cosmic_SVinv(9)(p13p13)  Cosmic_SV [COST116673]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU328]
    9p139p13Cosmic_SVinv(9)(p13p13)  Cosmic_SV [COST119217]pancreas__NScarcinoma__ductal_carcinoma [COSU328]
    9p139q13dbCRIDinv(9)(p13q13) 10673Hypohidrotic Ectodermal Dysplasia[PubMed] 
      Mitelmant(1;9)(p36;q13)  Mitelman (CGAP) Follicular lymphoma  
      Mitelmant(1;9)(q12;q13)  Mitelman (CGAP) Multiple myeloma  
      Mitelmant(5;9)(q11;q13)  Mitelman (CGAP) Acute megakaryoblastic leukemia (FAB type M7)  
    8p119q13dbCRIDt(8;9)(p11.2;q13)NM_033655.3 11732[PubMed] 
      Mitelmant(8;9)(q24;q13)  Mitelman (CGAP) Mantle cell lymphoma  
    8q249q13Atlas - Leukemiat(8;9)(q24;q13)  t0809q24q13ID1550NHL::B-ALL[Biblio] 
      Mitelmant(9;12)(q13;q24)  Mitelman (CGAP) Diffuse large B-cell lymphoma  
      Mitelmant(9;17)(q13;p11)  Mitelman (CGAP) Acute lymphoblastic leukemia/lymphoblastic lymphoma  
    10q239q13Cosmic_SVu(10;9)(q23;q13)  Cosmic_SV [COST749482]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma [COSU537]
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    9q139q13Cosmic_SVu(9)(q13;q13)  Cosmic_SV [COST729983]prostate__NScarcinoma__adenocarcinoma [COSU537]
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    Genes in band 9q13

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    GoldenPath hg38Band 1Band 2ClassCloneFusionPartner 1Partner 2LinksTopographyMorphologyPubmedOmimAccession
    chr9:61861564-61862615 - 9q13   Gene [G]     LOC105379807       [Omim] [Entrez]
    chr9:61867082-61869138 - 9q13   Gene [G]     LOC102723709       [Omim] [Entrez]
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    chr9:62532562-62542812 + 9q13   Gene [G]     LOC103908604       [Omim] [Entrez]
    chr9:62801465-62813486 + 9q13   Gene [G]     LINC01410       [Omim] [Entrez]
    chr9:62834248-62838346 - 9q13   Gene [G]     LOC100132249       [Omim] [Entrez]
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    chr9:62897376-62899777 + 9q13   Gene [G]     LOC728673       [Omim] [Entrez]
    chr9:63017995-63028857 + 9q13   Gene [G]     LOC101928381       [Omim] [Entrez]
    chr9:63064491-63125869 - 9q13   Gene [G]     LOC101928195       [Omim] [Entrez]
    chr9:63112403-63127100 - 9q13   Gene [G]     LOC286297       [Omim] [Entrez]
    chr9:63315243-63334520 - 9q13 22q12 Gene [CT]   AQP7P1/RBFOX2 AQP7P1 RBFOX2 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr9:63315243-63334520 - 9q13 22q13 Gene [CT]   AQP7P1/TSPO AQP7P1 TSPO [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr9:63315243-63334520 - 9q13   Gene [G]     AQP7P1       [Omim] [Entrez]
    chr9:63812941-63819029 + 9q13   Gene [G]     LINC00537       [Omim] [Entrez]
    chr9:63832050-63859634 - 9q13   Gene [G]     FRG1JP       [Omim] [Entrez]
    chr9:64016950-64061612 + 9q13 8q24 Gene [CT]   NDUFB9/FLJ43315 FLJ43315 NDUFB9 [ChiTaRS]       [Omim] [GenBank]
    chr9:64016950-64061612 + 9q13   Gene [G]     FLJ43315       [Omim] [Entrez]
    chr9:64369394-64469242 + 9q13   Gene [G]     ANKRD20A4-ANKRD20A20P       [Omim] [Entrez]
    chr9:64369563-64412691 + 9q13   Gene [G]     ANKRD20A4   [Cosmic]     [Omim] [Entrez]

    [ Bold normal : A; Italic normal :G; Italic small : E ]

    X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22
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    External links

    Mitelman Database [NCI] : Breakpoint 9q13

    [ UCSC ][ enSembl ][ MapView - NCBI ][ 1000Genomes ][ EVS ][ CGWB ][ DGV ][ DBVar ][ OMIM ][ HapMap ][ DECIPHER ] [ ECARUCA ]
    Gene Expression (MSigDB) in 9q13  [ HTC ]  [ NCI ]  [ INV ]

    Global tables

  • Anomalies list (tabulated txt file)
  • Genes list (tabulated txt file)
  • Anomalies list - limited to abnormalities with gene fusions(tabulated txt file)
  • Genes list - limited to genes fusions (tabulated txt file)
  • list of gene fusions for each gene (with origins of the data)
  • list of gene fusions by origin (with topography and morphology)

    References

    Contributor(s)

    Writtenmay 2012Philippe Dessen
      
    Updatedsept. 2019Philippe Dessen and Jean-Loup Huret

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P and Huret JL. Chromosomal band 9q13. Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. July 2012.
    URL : http://atlasgeneticsoncology.org/Bands/9q13.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : mer. sept. 25 14:02:24 CEST 2019


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