Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology

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Chromosome 11

Chromosome 11 : G-banding, diagram and R-banding - Claude Léonard, Jean-Loup Huret

Leukaemia     

t(1;11)(p32;q23) (AML, ALL; AF1P and MLL; not rare)
t(1;11)(q23;p15)
t(1;11)(q21;q23)
t(2;11)(p21;q23)
t(2;11)(q11;q23)
t(2;11)(q31;p15) (MDS, AML; NUP98 and HOXD13; rare)
t(2;11)(q31;p15) (MDS, AML; NUP98 and HOXD11; rare)
t(2;11)(q37;q23) (AML; SEPT2 and MLL; rare)
t(2;11)(q37;q23) in AML
t(3;11)(p21;q23)
t(3;11)(p24;p15) (AML; NUP98 and TOP2B; rare)
t(3;11)(q21;q23) (AML; EEFSEC and MLL; rare)
t(3;11)(q26;p15)
t(3;11)(q27;q23) (NHL; BCL6 and OBF1, rare)
t(3;11)(q28;q23)
t(4;11)(q21;q23)
t(4;11)(p12;q23)
t(4;11)(q21;p15)
t(4;11)(q35;q23) (AML; ArgBP2 and MLL; rare)
ins(5;11)(q31;q13q23)
t(5;11)(q31;q23)
t(5;11)(q35;p15.5)
t(6;11)(q27;q23)
t(6;11)(q13;q23)
t(6;11)(q21;q23) (AML, T-NHL; AF6q21 and MLL; rare)
t(7;11)(p15;p15)
t(7;11)(q35;p13)
t(8;11)(p11;p15)
t(9;11)(p22;q23)
t(9;11)(q34;q23) FBP17/MLL
t(9;11)(p22;p15)
t(9;11)(q34;p15)
t(9;11)(q34;q23) (AF9q34-MLL)
t(X;11)(q13;q23)
t(X;11)(q21;q23)
t(X;11)(q24;q23) (AML; SEPT6 and MLL; rare)
t(10;11)(p12;q23)
t(10;11)(p11.2;q23)
t(10;11)(p13;q21)
t(10;11)(q22;q23)
t(10;11)(q25;p15)
11p15 rearrangements in treatment related leukemia
11q23 rearrangements in childhood acute lymphoblastic leukemia
11q23 rearrangements in leukaemia
11q23 rearrangements in therapy related leukaemias
del(11)(p12p13)
del(11q) in non-Hodgkin's lymphoma (NHL)
inv(11)(p15q22)
inv(11)(q21;q23) in therapy related leukemias
+11 or trisomy 11 (solely)
t(11;12)(p15;p13)
t(11;12)(q23;q13) (/HMGA2)
t(11;12)(q23;q13) (MLL/CIP29)
t(11;14)(p13;q11)
t(11;14)(q13;q32)
t(11;14)(q13;q32) in multiple myeloma
t(11;14)(p11;q32)
t(11;14)(p15;q11)
t(11;14)(q23;q24)
t(11;15)(q23;q14)
t(11;17)(q23;q21)
t(11;17)(q13;q21)
t(11;17)(q23;q25)
t(11;17)(q23;p13)
t(11;17)(q23;q12) MLL/RARa
t(11;17)(q23;q12-21) MLL/AF17
t(11;17)(q23;q12-21) MLL/LASP1
t(11;18)(q21;q21)
t(11;19)(q23;p13.1)
t(11;19)(q23;p13.3)
t(11;20)(p15;q11)
t(11;20)(q23;q11)
t(11;12)(p15;q13)
t(11;22)(q23;q13)
t(11;22)(q23;q11.2)

Solid Tumors     

t(2;11)(p23;p15)
t(2;11)(p23;p15)
t(6;11)(p21;q12)
t(11;12)(q23;q15)
t(12;13)(q14;q12)
t(11;16)(q13;p13)
t(11;19)(q21;p13)
t(11;19)(q11;q13.4)
t(11;19)(q21-22;p13)
t(11;22)(q24;q12)
t(11;22)(p13;q11)
t(11;22)(p13;q12)

Cancer prone diseases     

Beckwith-Wiedemann syndrome
Hemihyperplasia isolated
Multiple Endocrine Neoplasia type 1 (MEN1)
Multiple Endocrine Neoplasia type 2 (MEN2)
WAGR (Wilms' tumor/aniridia/genitourinary anomalies/mental retardation syndrome)
Ataxia telangiectasia

All Genes by Location (Kb)
Chromosome 11 by location

Losses / Amplicons     

BONE/SOFT TISSUE

External links     

  • Chromosome 11 - HUGO Chromosomes
  • Chromosome 11 - GoldenPath - Santa Cruz
  • Chromosome 11 - Ensembl Project
  • Chromosome 11 - Map View - NCBI
  • Chromosome 11 - GDB (Genome Data Base)
  • Chromosome 11 - OMIM Gene map
  • Chromosome 11 - Genomic Variants
  • Chromosome 11 - HAPMAP Project
  • Chromosome 11 - Genome Channel - ORNL
  • Chromosome 11 - LaunchPad HGMIS
  • Chromosome 11 - Human Protein Atlas
  • Chromosome 11 - SpliceNest
  • Human BAC Resource (NCBI)
  • FISH-mapped BACs (CCAP)
  • Genetic Maps (CHLC)
  • YACs mapped by FISH (Bari)
  • PCP (Partial Chromosome Paints) (Bari)
  • Positional Cloning Project (Berlin Dahlem)
  • Mouse homology - OMIM - NCBI
  • Cancer GeneWeb
  • GeneCards (Weizmann)
  • Human Proteomics Initiative (Expasy)

    • Genes

    Annotated genes
    Ordered by Name Ordered by Location
     Kb pter-qter
    ARHGAP20 109952.976 11q23.2
    ARHGEF12 119713.156 11q23.3
    ATM 107598.769 11q22-q23
    BAD 63793.878 11q13.1
    BIRC3 101693.404 11q22
    C11orf30 75833.717 11q13.5
    CARS 2978.735 11p15.5
    CASP1 104401.447 11q23
    CBL 118582.200 11q23.3-qter
    CCND1 69165.054 11q13
    CHKA 67576.902 11q13.1
    DDB2 47193.069 11p12-p11
    DDX10 108041.026 11q22-q23
    EXT2 44073.675 11p12-p11
    FANCF 22600.655 11p15
    HRAS 522.242 11p15.5
    KAT5 65236.065 11q13
    LMO2 33836.699 11p13
    MAML2 95351.088 11q21
    MEN1 64327.570 11q13
    MLL 117812.415 11q23
    MRE11A 93790.115 11q21
    MYEOV 68818.198 11q13.2
    NUMA1 71391.559 11q13
    NUP98 3689.635 11p15
    PAK1 76710.708 11q13-q14
    PICALM 85346.133 11q14
    POU2AF1 110728.190 11q23.1
    RELA 65178.393 11q13
    RSF1 77054.922 11q13.5
    SDHD 111462.832 11q23
    SPA17 124048.950 11q24.2
    SPI1 47332.985 11p12-p11.22
    WT1 32365.901 11p13
    ZBTB16 113436.498 11q23
    Other genes
    possibly implicated
    in cancer
    Ordered by Name Ordered by Location
     Kb pter-qter
    ACAT1 107497.468 11q22.3
    ACP2 47217.429 11p11.2
    ADAMTS15 129824.079 11q25
    ADAMTS8 129780.028 11q25
    ADM 10283.218 11
    ADRBK1 66790.481 11q13
    AHNAK 62039.950 11q12-q13
    AIP 67007.097 11q13.3
    ALDH3B2 67186.209 11q13
    ALKBH3 43858.973 11p11.2
    ALKBH8 106880.544 11q22.3
    AMPD3 10428.800 11p15
    ANKK1 112763.723 11q23.2
    APBB1 6372.931 11p15
    API5 43290.109 11
    APLNR 56757.643 11q12
    APOA1 116211.679 11q23-q24
    ARCN1 117948.321 11q23.3
    ARFIP2 6453.502 11p15
    ARHGAP1 46655.208 11p11.2
    ARHGEF17 72697.317 11q13.3
    ARL2 64538.162 11q13
    ARRB1 74654.130 11q13
    ART1 3622.937 11p15
    ASCL2 2246.304 11p15.5
    B3GAT1 133753.608 11q25
    B3GNT6 76423.083 11q13.4
    BARX2 128751.091 11q24.3
    BCL9L 118272.061 11q23.3
    BDNF 27633.018 11p14.1
    BIRC2 101723.176 11q22
    BRMS1 65861.380 11q13-q13.2
    BRSK2 1367.705 11p15.5
    BTG4 110843.466 11q23
    C11orf17 8889.277 11p15.3
    C11orf68 65440.859 11q13.1
    C1QTNF4 47567.792 11q11
    C1QTNF5 118714.862 11q23.3
    CADM1 114549.555 11q23.2
    CALCA 14946.624 11p15.2
    CAPN1 64705.919 11q13
    CASP4 104318.804 11q22.2-q22.3
    CASP5 104370.172 11q22.2-q22.3
    CAT 34417.054 11p13
    CCDC73 32580.202 11p13
    CCKBR 6237.542 11p15.4
    CD151 822.952 11p15.5
    CD248 65838.534 11q13
    CD3E 117680.505 11q23
    CD44 35116.993 11p13
    CD5 60626.506 11q13
    CD59 33681.132 11p13
    CD6 60495.691 11q12.2
    CD81 2355.123 11pter-p11.2
    CD82 44543.717 11p11.2
    CDC42EP2 64838.907 11q13
    CDK2AP2 67030.544 11q13
    CDKN1C 2861.024 11p15.5
    CDON 125331.923 11q23-q24
    CENTD2 72073.762 11q13.3
    CEP57 95163.290 11q21
    CFL1 65378.861 11q13.1
    CHEK1 125000.246 11q24.2
    CHORDC1 89574.265 11q14.3
    CHRDL2 74085.122 11
    CKAP5 46721.660 11p11.2
    CLCF1 66888.215 11q13.3
    CLP1 57181.206 11q12
    CNTF 58146.721 11q12
    CNTN5 98397.081 11q21-q22.2
    COP1 104417.263 -
    COX8A 63498.655 11q12-q13
    CPT1A 68278.664 11q13.2
    CREB3L1 46255.804 11q11
    CRTAM 122214.465 11q24.1
    CRY2 45825.245 11p11.2
    CRYAB 111284.560 11q22.3-q23.1
    CST6 65536.038 11q13
    CTNND1 57285.810 11q12.1
    CTSD 1730.561 11p15.5
    CTSF 66087.511 11q13.2
    CTTN 69922.260 11q13
    CUL5 107384.618 11q22.3
    CXCR5 118259.751 11q23.3
    CYB5R2 7642.902 11p15.4
    DCPS 125678.857 11q24
    DDB1 60823.495 11q12-q13
    DDX25 125279.482 11q24
    DDX6 118123.683 11q23.3
    DEAF1 634.225 11p15.5
    DGKZ 46339.721 11p11.2
    DKK3 11941.119 11p15.3
    DLAT 111400.748 11q23.1
    DNAJC4 63754.329 11q13
    DPF2 64857.922 11q13.1
    DPP3 66004.456 11q12-q13.1
    DRD2 112785.527 11q23
    DUSP8 1531.857 11p15.5
    DYNC2H1 102485.370 11q21-q22.1
    EED 85633.463 11q14.2-q22.3
    EHF 34599.244 11p12
    EI24 124944.508 11q23
    EIF3F 7965.443 11p15.4
    EIF4G2 10775.169 11p15
    ELF5 34456.918 11p13-p12
    ESRRA 63829.620 11q12
    ETS1 127833.870 11q23.3
    F2 46697.319 11p11-q12
    FADD 69726.917 11q13.3
    FADS2 61352.289 11q12.2
    FAM111B 58631.286 11q12.1
    FAM89B 65096.396 11q23
    FAT3 91724.910 11q14.3
    FAU 64644.678 11q13
    FBXL11 66644.074 11q13.1
    FCHSD2 72225.438 11q13.3
    FEN1 61316.726 11q12
    FEZ1 124820.858 11q24.2
    FGF19 69222.187 11q13.1
    FGF3 69333.917 11q13
    FGF4 69296.978 11q13.3
    FLI1 128069.023 11q24.1-q24.3
    FLRT1 63627.938 11q12-q13
    FOLH1 49124.763 11p11.2
    FOLR1 71578.607 11q13.3-q14.1
    FOLR2 71605.467 11q13.3-q14.1
    FOSL1 65416.268 11q13
    FOXR1 118347.627 11q23.3
    FRAG1 3786.360 11p15.5
    FTH1 61488.333 11q13
    FUT4 93916.775 11q12-qter
    FXC1 6459.253 11p15.2-q15.5
    FZD4 86334.369 11q14-q21
    GAB2 77603.990 11q14.1
    GAL 68208.559 11q13.2
    GAS2 22652.931 11p14.3
    GCRG224 82211.056 11q13-q14
    GNG3 62231.709 11p11
    GRM5 87880.626 11q14.3
    GSTP1 67107.642 11q13-qter
    GTF2H1 18300.719 11p15.1-p14
    H19 1972.983 11p15.5
    H2AFX 118469.795 11q23.3
    HBB 5203.272 11p15.5
    HCCA2 1447.269 11p15.5
    HEPACAM 124294.356 11q24.2
    HEPN1 124294.356 -
    HIPK3 33235.744 11p13
    HPS5 18256.793 11p14
    HRASLS3 63098.520 11q12.3
    HSPA8 122433.410 11q24.1
    HSPB2 111288.709 11q22-q23
    HTATIP2 20341.865 11
    HTR3A 113351.120 11q23.1-q23.2
    HYOU1 118420.106 11q23.1-q23.3
    ICEBERG 104513.879 11q21-q22
    IFITM1 303.991 11p15.5
    IGF2 2106.923 11p15.5
    IGF2AS 2118.313 11p15.5
    IGHMBP2 68427.895 11q13.3
    IL10RA 117362.319 11q23
    IL18 111519.186 11q22.2-q22.3
    ILK 6581.540 11p15.4
    INCENP 61648.021 11q12.3
    INPPL1 71613.473 11q23
    INS 2137.585 11p15.5
    IPO7 9362.780 11p15.3
    IRF7 602.555 11p15.5
    JAM3 133444.030 11q25
    JMJD2D 94346.493 11q21
    KCNJ5 128266.523 11q24
    KCNQ1 2422.797 11p15.5
    LDHA 18372.558 11p15.1
    LDHC 18390.434 11p15.1
    LGR4 27344.084 11p14-p13
    LMO1 8202.433 11p15
    LPXN 58050.920 11
    LRDD 789.179 11p15.5
    LRP5 67836.684 11q13.4
    LSP1 1846.479 11p15.5
    LTBP3 65062.606 11q12
    LYVE1 10535.989 11p15
    MADD 47247.775 11p11.2
    MALAT1 65025.123 11q13.1
    MAP3K11 65121.802 11q13.1-q13.3
    MAP4K2 64313.185 11q13.1
    MAPK8IP1 45863.778 11p11.2
    MARK2 63363.471 11q13
    MCAM 118684.444 11q23.3
    MDK 46359.879 11p11.2
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