Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology

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Chromosome 19

Chromosome 19 : G-banding, diagram and R-banding - Claude Léonard, Jean-Loup Huret
Chromosome 19 diagrams ISCN 2009 - Courtesy Nicole Chia

Leukaemia     

t(1;19)(p13;p13.1)
t(1;19)(q23;p13)
t(2;19)(p11;p13)
t(2;19)(p12;q13) IGK/BCL3
t(3;19)(q27;q13) (NHL; BCL6 and NAPA; rare)
t(7;19)(q34;p13)
t(8;19) (p11;q13)
t(8;19)(p12;q13)
t(11;19)(q23;p13.1)
t(11;19)(q23;p13.3)
t(11;19)(q23;p13.3) MLL/ACER1
t(12;19)(p13;p13)
t(12;19)(q13;q13)
t(14;19)(q32;q13) IGH/BCL3
t(14;19)(q32;q13) IGH/CEBPA
t(17;19)(q22;p13)
inv(19)(p13q13) TCF3/TFPT
Trisomy 19
t(19;21)(q13.4;q22)
t(19;22)(q13;q11) BCL3/IGL

Solid Tumors     

t(2;19)(p23;p13)
t(2;19)(p23;p13.1)
t(2;19)(p23;p13.1)
t(11;19)(q21;p13)
t(11;19)(q11;q13.4)
t(11;19)(q21-22;p13)
t(15;19)(q14;p13)
del(1p)

Cancer prone diseases     

Congenital neutropenia
Diamond-Blackfan anemia (DBA)
Peutz-Jeghers syndrome

All Genes by Location (Kb)
Chromosome 19 by location

Losses / Amplicons     

BONE/SOFT TISSUE

External links     

  • Chromosome 19 - HUGO Chromosomes
  • Chromosome 19 - GoldenPath - Santa Cruz
  • Chromosome 19 - Ensembl Project
  • Chromosome 19 - Map View - NCBI
  • Chromosome 19 - OMIM Gene map
  • Chromosome 19 - Genomic Variants
  • Chromosome 19 - HAPMAP Project
  • Chromosome 19 - Genome Channel - ORNL
  • Chromosome 19 - LaunchPad HGMIS
  • Chromosome 19 - Human Protein Atlas
  • Chromosome 19 - Array BAC clone - Roswell Park Cancer Institute
  • Chromosome 19 - Human BAC Resource (NCBI)
  • Chromosome 19 FISH-mapped BACs (CCAP)
  • Genetic Maps (CHLC)
  • YACs mapped by FISH (Bari)
  • PCP (Partial Chromosome Paints) (Bari)
  • Mouse homology - OMIM - NCBI
  • Chromosome 19 Cancer GeneWeb
  • Chromosome 19 GeneCards (Weizmann)
  • Human Proteomics Initiative (Expasy)

    • Genes

    Annotated genes
    Ordered by Name Ordered by Location
     Kb pter-qter
    AKT2 40738.243 19q13.1-q13.2
    ATF5 50432.459 19q13.3
    AXL 41732.659 19q13.1
    BAX 49458.185 19q13.3-q13.4
    BBC3 47724.084 19q13.3-q13.4
    BCL2L12 50169.263 19q13.3
    BRD4 15348.301 19p13.1
    CARD8 48711.512 19q13.33
    CBLC 45281.147 19q13.2
    CD97 14492.255 19p13
    CEACAM1 43013.262 19q13.2
    CEBPA 33792.921 19q13.1
    CRTC1 18794.559 19p13.11
    CYP2A6 41349.567 19q13.2
    DNMT1 10244.022 19p13.2
    DYRK1B 40315.990 19q12-q13.1
    ELL 18553.474 19p13.1
    ERCC2 45854.852 19q13.3
    FSTL3 676.391 19p13
    GADD45GIP1 13064.981 19p13.2
    GDF15 18496.967 19p13.11
    GLTSCR2 48257.993 19q13.3
    ICAM1 10381.835 19p13.3-p13.2
    JAK3 17949.078 19p13.1
    JUNB 12902.295 19p13.2
    JUND 18390.703 19p13.2
    KLK10 51517.526 19q13
    KLK11 51525.488 19q13.33
    KLK4 51409.607 19q13.41
    KLK5 51446.560 19q13.33
    KLK7 51480.044 19q13.41
    LYL1 13209.847 19p13.2
    LYPD3 43964.938 19q13.31
    MARK4 45754.549 19q13.3
    MLLT1 6262.240 19p13.3
    MUC16 8959.520 19p13.2
    NOTCH3 15288.721 19p13.2-p13.1
    PAF1 39876.492 19q13.1
    PPP1R13L 45882.894 19q13.32
    RELB 45504.799 19q13.32
    RUVBL2 49497.155 19q13.3
    SCAF1 50145.381 19q13.3-q13.4
    SH3GL1 4360.367 19p13.3
    SLC5A5 17999.194 19p13.2-p12
    SMARCA4 11094.954 19p13.2
    STK11 1206.822 19p13.3
    TCF3 1609.292 19p13.3
    TFPT 54610.329 19q13
    TPM4 16187.372 19p13.1
    VAV1 6772.724 19p13.2
    Other genes
    possibly implicated
    in cancer
    Ordered by Name Ordered by Location
     Kb pter-qter
    ACP5 11685.474 19p13.3-p13.2
    ACPT 51293.671 19q13.4
    ADAMTS10 8649.846 19p13.2
    ADCK4 41197.434 19q13.2
    AES 3053.172 19p13.3
    AKAP8 15472.283 19p13.1
    AKT1S1 50372.302 19q13.33
    ALKBH6 36500.174 19q13.12
    ALKBH7 6372.820 19p13.3
    ANGPTL4 8429.037 19p13.3
    ANGPTL6 10203.012 19p13.2
    AP1M2 10683.347 19p13.2
    AP2A1 50303.305 19q13.33
    AP3D1 2100.992 19p13.3
    APC2 1451.287 19p13.3
    APLP1 36359.464 19q13.1
    APOE 45409.052 19q13.2
    ARHGEF1 42392.856 19q13.13
    ARID3A 929.328 19p13.3
    ASF1B 14231.272 19p13.12
    ASNA1 12848.317 19q13.3
    ATG4D 10654.753 19p13.2
    ATP8B3 1782.075 19p13.3
    AURKC 57742.458 19q13.43
    AZU1 825.096 19p13.3
    B3GNT8 41931.490 19q13.2
    BCAM 45316.773 19q13.2
    BCL3 45250.961 19q13.1-q13.2
    BIRC8 53792.855 -
    BRSK1 55798.426 19q13.4
    BSG 572.620 19p13.3
    BST2 17513.801 19p13.1
    BTBD2 1985.446 19p13.3
    C19orf33 38794.803 19q13.2
    C19orf40 33463.155 19q13.11
    C19orf48 51300.967 19q13.33
    C19orf53 13885.284 19p13.2
    C19orf6 1006.167 19p13.3
    C19orf62 17378.241 19p13.11
    CADM4 44126.521 19q13.31
    CALR 13049.493 19p13.3-p13.2
    CAPNS1 36630.888 19q13.12
    CARM1 11024.582 19p13.2
    CASP14 15163.014 19p13.1
    CCL25 8117.933 19p13.2
    CCNE1 30302.900 19q12
    CD209 7804.882 19p13
    CD22 35820.089 19q13.1
    CD33 51729.221 19q13.3
    CD3EAP 45909.948 19q13.3
    CD70 6583.134 19p13
    CD79A 42381.192 19q13.2
    CDC34 531.730 19p13.3
    CDC37 10502.229 19p13.2
    CDKN2D 10677.138 19p13
    CEACAM3 42300.583 19q13.2
    CEACAM4 42125.917 19q13.2
    CEACAM5 42212.567 19q13.1-q13.2
    CEACAM6 42259.442 19q13.2
    CEACAM7 42181.336 19q13.2
    CEACAM8 43084.705 19q13.2
    CEBPG 33864.699 19q13.11
    CGB 49526.126 19q13.32
    CGB5 49547.140 19q13.32
    CHMP2A 59062.933 19q
    CIB3 16272.205 19p13.12
    CIC 42791.488 19q13.2
    CIRBP 1270.932 19p13.3
    CLC 40221.972 19q13.1
    CLPP 6361.562 19p13.3
    CLPTM1 45458.637 19q13.3
    CNN1 11649.665 19p13.2-p13.1
    COMP 18893.724 19p13.1
    COPE 19010.323 19p13.11
    COX6B1 36139.227 19q13.1
    COX6B2 55861.075 19q13.42
    COX7A1 36641.885 19q13.1
    CRX 48323.800 19q13.3
    CSNK1G2 1969.771 19p13.3
    CXCL17 42932.905 19q13.2
    CYP2A13 41594.376 19q13.2
    CYP2B6 41497.208 19q13.2
    CYP2F1 41620.336 19q13.2
    CYP4F3 15751.706 19p13.2
    CYTH2 48972.603 19q13.33
    DACT3 47150.869 19q13.32
    DAND5 13080.474 19p13.2
    DAPK3 3958.451 19p13.3
    DBP 49133.949 19q13.3
    DDA1 17430.919 19p13.11
    DDX39 14520.721 19p13.12
    DDX49 19030.534 19p12
    DHDH 49436.978 19q13.3
    DIRAS1 2717.129 19p13.3
    DMPK 46272.977 19q13.3
    DNAJB1 14625.581 19p13.2
    DOT1L 2210.698 19p13.3
    DPP9 4675.237 19p13.3
    EEF2 3976.355 19pter-q12
    EFNA2 1286.152 19p13.3
    EGLN2 41306.180 19q13.2
    EID2 40029.448 19q13.2
    ELANE 852.291 19p13.3
    EPHX3 15337.730 19p13.12
    EPOR 11488.659 19p13.3-p13.2
    EXOSC5 41892.280 19q13.1
    F2RL3 16999.825 19p12
    FARSA 13033.293 19p13.2
    FBL 40325.180 19q13.1
    FBXL12 9920.944 19p13.2
    FBXO46 46213.888 19q13.3
    FCAR 55385.690 19q13.2-q13.4
    FCER2 7753.666 19p13.3
    FEM1A 4791.867 19p13.3
    FFAR1 35842.457 19q13.1
    FGF21 49259.493 19q13.1-qter
    FGF22 639.925 19p13.3
    FKBP8 18642.573 19p12
    FOSB 45971.253 19q13.32
    FOXA3 46367.588 19q13.2-q13.4
    FPR1 52249.195 19q13.4
    FPR2 52271.911 19q13.3-q13.4
    FSD1 4304.700 19p13.3
    FTL 49469.114 19q13.33
    FUT1 49253.421 19q13.3
    FUT2 49199.231 19q13.3
    FUT3 5842.900 19p13.3
    FUT5 5866.318 19p13.3
    FUT6 5830.636 19p13.3
    FZR1 3522.987 19p13.3
    GADD45B 2476.256 19p13.3
    GAPDHS 36024.396 19q13.12
    GDF1 18980.842 19p12
    GIPC1 14588.584 19p13.1
    GIPR 46171.514 19q13.3
    GNA11 3094.655 19p13.3
    GNA15 3136.448 19p13.3
    GNG7 2514.447 19p13.3
    GNG8 47137.333 19q13.32
    GPI 34856.138 19q13.1
    GPR4 46093.901 19q13.3
    GPX4 1104.005 19p13.3
    GRLF1 47421.932 19q13.3
    GSK3A 42734.341 19q13.2
    GYS1 49472.412 19q13.3
    GZMM 544.061 19p13.3
    HAMP 35773.434 19q13.1
    HAPLN4 19368.625 19p13.1
    HAS1 52217.144 19q13.4
    HAUS8 17160.577 19p13.11
    HCST 36393.439 19q13.1
    HIF3A 46806.924 19q13.32
    HIPK4 40885.178 19q13.2
    HKR1 37825.567 19q13.12
    HMG20B 3574.259 19p13.3
    HMHA1 1077.441 19p13.3
    HNRNPM 8509.883 19p13.3-p13.2
    HPN 35554.921 19q11-q13.2
    HSD11B1L 5681.035 19p13.3
    HSPB6 36245.468 19q13.12
    HSPBP1 55773.707 19q13.42
    ICAM3 10444.507 19p13.3-p13.2
    ICAM4 10397.649 19p13.2-cen
    IER2 13263.892 19p13.2
    IFI30 18284.602 19p13.1
    IL11 55877.239 19q13.3-q13.4
    IL12RB1 18181.371 19p13.1
    IL27RA 14142.551 19p13.11
    IL28A 39759.156 19q13.13
    IL28B 39734.272 19q13.13
    IL29 39786.964 19q13.13
    IL4I1 50392.915 19q13.3-q13.4
    INSL3 17927.323 19p13.2-p12
    INSR 7116.149 19p13.3-p13.2
    IRF3 50165.795 19q13.3-q13.4
    ISOC2 55964.355 19q13.42
    ISYNA1 18545.623 19p13.11
    ITGB1BP3 3933.596 19p13.3
    KCNN4 44271.694 19q13.2
    KDM4B 4969.131 19p13.3
    KEAP1 10596.801 19p13.2
    KIR2DL1 55281.295 19q13.4
    KIR2DS4 55344.173 19q13.4
    KIR3DL1 55327.955 19q13.4
    KLF2 16435.734 19p13.13-p13.11
    KLK1 51322.403 19q13.3
    KLK12 51532.347 19q13.33
    KLK13 51559.845 19q13.33
    KLK14 51580.574 19q13.3-q13.4
    KLK15 51328.565 19q13.41
    KLK2 51376.713 19q13.41
    KLK3 51358.170 19q13.41
    KLK6 51461.886 19q13.3
    KLK8 51499.266 19q13
    KLK9 51506.367 19q13.41
    KLKP1 51385.353 19q13.41
    LAIR1 54866.132 19q13.4
    LGALS13 40093.203 19q13.1
    LHB 49519.319 19q13.32
    LIG1 48618.706 19q13.2-q13.3
    LILRB1 55142.524 19q13.4
    LILRB4 55174.456 19q13.4
    LPAR2 19734.477 19p12
    LSM4 18417.717 19p13.11
    LSR 35739.781 19q13.12
    LTBP4 41107.276 19q13.1-q13.2
    MAG 35783.063 19q13.1
    MAP2K7 7968.768 19p13.3-p13.2
    MAP3K10 40697.936 19q13.2
    MAP4K1 39087.990 19q13.1-q13.4
    MAST1 12949.347 19p13.2
    MAST3 18208.604 19p13.11
    MATK 3777.972 19p13.3
    MBD3 1576.677 19p13.3
    MBD3L1 8953.354 19p13.2
    MBD3L2 7049.349 19p13.2
    MBOAT7 54677.107 19q13.4
    MED29 39882.032 19q13.2
    MEX3D 1554.671 19p13.3
    MIA 41277.552 19q13.32-q13.33
    MKNK2 2037.471 19p13.3
    MLL4 36211.149 19q13.1
    MUM1 1371.043 19p13.3
    MYO1F 8585.673 19p13.3-p13.2
    MZF1 59076.305 19q13.4
    NACC1 13229.150 19p13.2
    NAPSA 50861.732 19q13.33
    NCR1 55417.507 19q13.42
    NDUFA13 19626.595 19p13.2
    NFIX 13135.394 19p13.3
    NFKBIB 39390.603 19q13.1
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    NOVA2 46442.790 19q13.3
    NR1H2 50880.862 19q13.3
    NR2F6 17343.161 19p13.1
    NRTN 5823.817 19p13.3
    NTF4 49559.049 19q13.3
    NUCB1 49404.050 19q13.33
    NUMBL 41172.597 19q13.13-q13.2
    OAZ1 2269.518 19p13.3
    PAK4 39616.473 19q13.2
    PBX4 19672.523 19p12
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    PEPD 33877.855 19q13.11
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    PPAN 10217.043 19p13
    PPFIA3 49622.662 19q13.33
    PPP1R12C 55602.783 19q13.42
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    PPP5C 46866.291 19q13.3
    PRAM1 8554.940 19p13.2
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    PRKACA 14208.466 19p13.1
    PRKCG 54385.718 19q13.4
    PRKCSH 11546.938 19p13.2
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    PRMT1 50188.083 19q13.3
    PRPF31 54621.788 19q13.42
    PRTN3 840.973 19p13.3
    PSENEN 36236.501 19q13.12
    PSG2 43568.362 19q13.1-q13.2
    PSG9 43757.630 19q13.2
    PTBP1 797.445 19p13.3
    PTGER1 14583.373 19p13.1
    PTGIR 47124.537 19q13.3
    PTOV1 50359.392 19q13.33
    PTPRS 5158.505 19p13.3
    PVRL2 45349.633 19q13.2
    RAB11B 8455.300 19p13.2
    RAB3A 18308.151 19p13.2
    RAB3D 11432.842 19p13.2
    RAB4B 41284.176 19q13.2
    RAB8A 16222.724 19p13.1
    RABAC1 42460.837 19q13.2
    RAD23A 13056.704 19p13.2
    RANBP3 5916.153 19p13.3
    RASGRP4 38900.479 19q13.1
    RASIP1 49223.842 19q13.33
    REEP6 1491.189 19p13.3
    RETN 7733.993 19p13.2
    RFXANK 19303.763 19p12
    RGL3 11495.187 19p13.2
    RNF126 647.810 19p13.3
    RPL28 55897.715 19q13.4
    RPS19 42364.324 19q13.2
    RPS5 58898.635 19q13.4
    RPS9 54704.725 19q13.4
    RRAS 50138.832 19q13.3-qter
    S1PR2 10334.520 19p13.2
    S1PR5 10623.622 19p13.2
    SAFB 5623.128 19p13.3-p13.2
    SAFB2 5600.210 19p13.3
    SERTAD3 40946.750 19q13.2
    SGTA 2755.551 19p13
    SH2D3A 6752.174 19p13.3
    SHC2 416.592 19p13.3
    SHD 4279.658 19p13.3
    SIGLEC7 51645.587 19q13.3
    SIGLEC9 51628.185 19q13.41
    SIN3B 16940.210 19p13.11
    SIRT2 39369.208 19q13
    SIRT6 4174.106 19p13.3
    SLC1A5 47278.644 19q13.3
    SLC25A42 19221.383 19p13.11
    SLC8A2 47931.922 19q13.3
    SNRNP70 49607.355 19q13.3
    SPHK2 49123.771 19q13.2
    SPIB 50922.197 19q13.3-q13.4
    SPINT2 38755.220 19q13.1
    SPPL2B 2328.679 19p13.3
    SULT2A1 48374.420 19q13.3
    SULT2B1 49097.497 19q13.3
    SUPT5H 39936.211 19q13
    SUV420H2 55852.983 19q13.42
    SYT5 55684.463 19q|11p
    TBXA2R 3595.685 19p13.3
    TICAM1 4815.991 19p13.3
    TIMM13 2426.562 19p13.3
    TIMM44 7991.603 19p13.3-p13.2
    TLE6 2977.561 19p13.3
    TMEM161A 19230.430 19p13.11
    TNFAIP8L1 4652.179 19p13.3
    TNFSF14 6664.565 19p13.3
    TNNI3 55663.136 19q13.4
    TOMM40 45394.493 19q13
    TRIM28 59059.659 19q13.4
    TRIP10 6739.724 19p13.3
    TSKS 50243.014 19q13.3
    TYK2 10468.060 19p13.2
    TYROBP 36395.305 19q13.1
    UBE2M 59067.455 19q13.43
    UBE2S 55912.652 19q13.43
    UCA1 15940.171 19p13.12
    UPF1 18942.794 19p13.2-p13.11
    UPK1A 36157.719 19q13.13
    UQCRFS1 29698.296 19q12
    USF2 35760.010 19q13
    VASP 46010.721 19q13.2-q13.3
    VRK3 50479.723 19q13
    WDR83 12777.627 19p13.2
    WTIP 34981.279 19q13.11
    XAB2 7684.416 19p13.2
    XRCC1 44047.463 19q13.2
    ZBTB32 36203.829 19q13.1
    ZBTB7A 4047.751 19p13.3
    ZFP28 57050.316 -
    ZFP36 39897.486 19q13.1
    ZGLP1 10415.479 19p13.2
    ZNF134 58125.618 19q13.4
    ZNF224 44609.491 19q13.2
    ZNF296 45574.758 19q13.32
    ZNF331 54082.221 19q13.42
    ZNF350 52467.629 19q13.41
    ZNF43 21987.753 19p13.1-p12
    ZNF444 56652.697 19q13.43
    ZNF649 52393.473 19q13.41
    ZSCAN22 58838.389 19q13.43

    GeneCards  

    Contributor(s)

    WrittenJul 2004Philippe Dessen, Sakari Knuutila, Jean-Loup Huret
    Updated Jean-Loup Huret, Philippe Dessen

    Citation

    This paper should be referenced as such :
    Dessen P, Knuutila S, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. Jul 2004 .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_19.html
    Dessen P, Huret JL . Chromosome . Atlas Genet Cytogenet Oncol Haematol. .
    URL : http://AtlasGeneticsOncology.org/Indexbychrom/idxa_19.html
    © Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
    indexed on : Wed Sep 1 08:32:01 CEST 2010
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